RGD Reference Report - Epistasis, not numbers, regulates functions of clustered Dahl rat quantitative trait loci applicable to human hypertension. - Rat Genome Database

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Epistasis, not numbers, regulates functions of clustered Dahl rat quantitative trait loci applicable to human hypertension.

Authors: Charron, S  Duong, C  Menard, A  Roy, J  Eliopoulos, V  Lambert, R  Deng, AY 
Citation: Charron S, etal., Hypertension. 2005 Dec;46(6):1300-8. Epub 2005 Nov 14.
RGD ID: 1559293
Pubmed: PMID:16286573   (View Abstract at PubMed)
DOI: DOI:10.1161/01.HYP.0000192024.72367.c3   (Journal Full-text)

Quantitative trait loci (QTLs) for blood pressure (BP) were found on chromosome 10 of Dahl salt-sensitive rats and are potentially important to human essential hypertension. But their identities and how they influence BP together were not known. Presently, we first fine mapped existing QTLs, C10QTL1, C10QTL2, and C10QTL3, by constructing congenic strains. In the process, a new QTL, C10QTL4, was identified. Because the intervals harboring C10QTL1 and C10QTL4 contain a maximum of 16 and 10 possible genes, respectively, a limited number of specific gene targets has been identified to be QTLs residing in human homologous regions on chromosome 17. Moreover, because none of these candidates encodes a gene known to influence BP, the 2 QTLs will represent novel genes for BP regulations. Second, we used congenic strains with QTL combinations to analyze the interactions between the QTLs. Consequently, a double combination of C10QTL4 and C10QTL1 possessed the same BP as each of the 2 QTLs alone. BP of a triple combination of C10QTL4, C10QTL1, and C10QTL3 was not different from BP of the C10QTL4 and C10QTL1 double combination. These results demonstrate that C10QTL4, C10QTL1, and C10QTL3 are epistatic to one another in their BP effects. In contrast, when adding C10QTL2 into the triple formation of the 3 QTLs above to create a quadruple QTL combination, BP increased proportionately, indicating that C10QTL2 acts independently of C10QTL4, C10QTL1, and C10QTL3. The epistatic and additive interactions uncovered in the animal model will help elucidate similar interactions playing a role in human essential hypertension.



Disease Annotations    
hypertension  (IAGP)
Hypotension  (IAGP)

Phenotype Annotations    

Objects Annotated

QTLs
Bp279  (Blood pressure QTL 279)
Bp280  (Blood pressure QTL 280)
Bp281  (Blood pressure QTL 281)
Bp282  (Blood pressure QTL 282)

Objects referenced in this article
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QTL Am12 Aortic mass QTL 12 Rattus norvegicus
QTL Am13 Aortic mass QTL 13 Rattus norvegicus
QTL Am14 Aortic mass QTL 14 Rattus norvegicus
QTL Am15 Aortic mass QTL 15 Rattus norvegicus
QTL Bp309 Blood pressure QTL 309 Rattus norvegicus
QTL Bw185 Body weight QTL 185 Rattus norvegicus
QTL Cm105 Cardiac mass QTL 105 Rattus norvegicus
QTL Cm106 Cardiac mass QTL 106 Rattus norvegicus
QTL Cm107 Cardiac mass QTL 107 Rattus norvegicus
QTL Cm108 Cardiac mass QTL 108 Rattus norvegicus
QTL Cm109 Cardiac mass QTL 109 Rattus norvegicus
QTL Cm110 Cardiac mass QTL 110 Rattus norvegicus
QTL Cm111 Cardiac mass QTL 111 Rattus norvegicus
QTL Cm112 Cardiac mass QTL 112 Rattus norvegicus
QTL Cm113 Cardiac mass QTL 113 Rattus norvegicus
QTL Cm114 Cardiac mass QTL 114 Rattus norvegicus
QTL Cm69 Cardiac mass QTL 69 Rattus norvegicus
QTL Kidm58 Kidney mass QTL 58 Rattus norvegicus
QTL Kidm66 Kidney mass QTL 66 Rattus norvegicus
QTL Kidm67 Kidney mass QTL 67 Rattus norvegicus
QTL Kidm68 Kidney mass QTL 68 Rattus norvegicus
Strain SS.LEW-(D10Chm10-D10Rat11)/Ayd null Rattus norvegicus
Strain SS.LEW-(D10Wox51-D10Rat27)/Ayd null Rattus norvegicus

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