Cdh1 (cadherin 1) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Cdh1 (cadherin 1) Rattus norvegicus
Analyze
Symbol: Cdh1
Name: cadherin 1
RGD ID: 69279
Description: Enables beta-catenin binding activity and protein tyrosine kinase binding activity. Involved in several processes, including nervous system development; regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission; and response to Gram-positive bacterium. Is active in glutamatergic synapse and postsynapse. Used to study hepatocellular carcinoma and lung adenocarcinoma. Biomarker of pulmonary fibrosis and urinary bladder cancer. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including blepharocheilodontic syndrome 1; breast cancer (multiple); carcinoma (multiple); cervix uteri carcinoma in situ; and reproductive organ cancer (multiple). Orthologous to human CDH1 (cadherin 1); PARTICIPATES IN E-cadherin signaling pathway; fibroblast growth factor signaling pathway; endometrial cancer pathway; INTERACTS WITH (+)-pilocarpine; (+)-schisandrin B; (R)-carnitine.
Type: protein-coding
RefSeq Status: PROVISIONAL
Previously known as: cadherin-1; E-cadherin; epithelial cadherin; uvomorulin
RGD Orthologs
Human
Mouse
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Orthologs
More Info more info ...
Latest Assembly: mRatBN7.2 - mRatBN7.2 Assembly
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCr81951,402,178 - 51,471,572 (+)NCBIGRCr8
mRatBN7.21934,492,371 - 34,561,775 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl1934,492,371 - 34,561,775 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
UTH_Rnor_SHR_Utx1941,307,916 - 41,377,323 (+)NCBIRnor_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.01941,961,239 - 42,030,653 (+)NCBIRnor_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.01944,260,374 - 44,329,781 (+)NCBIRnor_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
Rnor_6.01938,768,467 - 38,838,395 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl1938,768,467 - 38,838,395 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.01949,635,965 - 49,705,893 (+)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.41936,442,693 - 36,512,091 (+)NCBIRGSC3.4RGSC_v3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.11936,447,573 - 36,516,972 (+)NCBI
Celera1933,919,043 - 33,988,306 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map19q12NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Disease Annotations     Click to see Annotation Detail View
acute myeloid leukemia  (ISO)
adenoid cystic carcinoma  (ISO)
Animal Mammary Neoplasms  (ISO)
asthma  (ISO)
autosomal dominant dyskeratosis congenita 6  (ISO)
autosomal recessive nonsyndromic deafness 77  (ISO)
blepharocheilodontic syndrome 1  (ISO)
breast cancer  (ISO)
Breast Cancer, Familial  (ISO)
breast carcinoma  (ISO)
breast lobular carcinoma  (ISO)
Breast Neoplasms  (ISO)
carcinoma  (ISO)
cerebrotendinous xanthomatosis  (ISO)
cervix uteri carcinoma in situ  (ISO)
Chromosome 16q12 Duplication Syndrome  (ISO)
cleft lip  (ISO)
colon cancer  (ISO)
colon carcinoma  (ISO)
colorectal cancer  (ISO)
Colorectal Neoplasms  (ISO)
diabetes mellitus  (ISO)
Disease Progression  (ISO)
Ductal Carcinoma  (ISO)
endometrial cancer  (ISO)
endometrial carcinoma  (ISO)
Endometrial Neoplasms  (ISO)
Endometrioid Carcinomas  (ISO)
Experimental Liver Cirrhosis  (IEP)
Experimental Liver Neoplasms  (ISO)
Experimental Mammary Neoplasms  (ISO)
Experimental Neoplasms  (ISO)
Familial Prostate Cancer  (ISO)
Fibrosis  (ISO)
gastric adenocarcinoma  (ISO)
genetic disease  (ISO)
GM1 gangliosidosis type 1  (ISO)
Helicobacter Infections  (ISO)
hepatoblastoma  (ISO)
hepatocellular carcinoma  (IDA,ISO)
hereditary breast ovarian cancer syndrome  (ISO)
hereditary diffuse gastric cancer  (ISO)
Hereditary Neoplastic Syndromes  (ISO)
hypomyelinating leukodystrophy 7  (ISO)
invasive ductal carcinoma  (ISO)
invasive lobular carcinoma  (ISO)
kidney disease  (ISO)
liver cancer  (ISO)
liver cirrhosis  (ISO)
lung adenocarcinoma  (IDA)
Lymphatic Metastasis  (ISO)
Mesothelioma  (ISO)
microphthalmia  (ISO)
mucoepidermoid carcinoma  (ISO)
Mycoplasma Infections  (ISO)
Neoplasm Invasiveness  (ISO)
Neoplasm Metastasis  (ISO)
Neoplasm Seeding  (ISO)
Neoplastic Cell Transformation  (ISO)
Nerve Degeneration  (ISO)
oral squamous cell carcinoma  (ISO)
orofacial cleft  (ISO)
ovarian cancer  (ISO)
Ovarian Neoplasms  (ISO)
pancreatic cancer  (ISO)
papillary thyroid carcinoma  (ISO)
pre-malignant neoplasm  (ISO)
prostate cancer  (ISO)
prostate carcinoma in situ  (ISO)
Prostatic Neoplasms  (ISO)
pulmonary fibrosis  (IEP,ISO)
renal cell carcinoma  (ISO)
Salivary Gland Neoplasms  (ISO)
spinocerebellar ataxia 45  (ISO)
squamous cell carcinoma  (ISO)
stomach cancer  (ISO)
Stomach Neoplasms  (ISO)
syndromic microphthalmia 5  (ISO)
ulcerative colitis  (ISO)
ureteral obstruction  (ISO)
urinary bladder cancer  (IEP,ISO)
Uterine Cervical Neoplasms  (ISO)

Gene-Chemical Interaction Annotations     Click to see Annotation Detail View
(+)-pilocarpine  (EXP)
(+)-schisandrin B  (EXP,ISO)
(+)-sesamin  (ISO)
(+)-Tetrandrine  (ISO)
(-)-citrinin  (ISO)
(-)-demecolcine  (ISO)
(-)-ephedrine  (ISO)
(-)-epigallocatechin 3-gallate  (ISO)
(2,4,5-trichlorophenoxy)acetic acid  (ISO)
(20S)-ginsenoside Rg3  (ISO)
(R)-carnitine  (EXP)
(S)-colchicine  (ISO)
(S)-nicotine  (ISO)
1,1,1-Trichloro-2-(o-chlorophenyl)-2-(p-chlorophenyl)ethane  (ISO)
1,2-dimethylhydrazine  (EXP,ISO)
1,4-dithiothreitol  (ISO)
1-nitropyrene  (ISO)
11-deoxycorticosterone  (ISO)
17alpha-ethynylestradiol  (EXP,ISO)
17beta-estradiol  (ISO)
17beta-hydroxy-17-methylestra-4,9,11-trien-3-one  (ISO)
2,2',4,4',5,5'-hexachlorobiphenyl  (EXP)
2,2',4,4'-Tetrabromodiphenyl ether  (ISO)
2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine  (EXP,ISO)
2,4-dibromophenyl 2,4,5-tribromophenyl ether  (ISO)
2,4-Dihydroxybenzophenone  (ISO)
2,6-di-tert-butyl-4-methylphenol  (ISO)
2,6-dinitrotoluene  (EXP)
2-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-\{[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl](methyl)amino\}-2-(propan-2-yl)pentanenitrile  (ISO)
2-Ethylhexanoic acid  (ISO)
2-hydroxypropanoic acid  (ISO)
3,3',4,4',5-pentachlorobiphenyl  (ISO)
3,3'-diindolylmethane  (ISO)
3,4-dihydroxybenzaldehyde  (ISO)
3-[3-(tert-butylsulfanyl)-1-(4-chlorobenzyl)-5-(propan-2-yl)-1H-indol-2-yl]-2,2-dimethylpropanoic acid  (ISO)
3-chloropropane-1,2-diol  (EXP)
3-methyl-3H-imidazo[4,5-f]quinolin-2-amine  (ISO)
3-methylcholanthrene  (ISO)
3-Nitrobenzanthrone  (ISO)
4,4'-sulfonyldiphenol  (ISO)
4-(N-nitrosomethylamino)-1-(3-pyridyl)butan-1-one  (ISO)
4-hydroxy-17beta-estradiol  (ISO)
4-hydroxyhexenal  (ISO)
4-hydroxynon-2-enal  (ISO)
4-hydroxyphenyl retinamide  (ISO)
4-tert-Octylphenol  (ISO)
5-aza-2'-deoxycytidine  (ISO)
5-azacytidine  (ISO)
5-fluorouracil  (ISO)
6-bromoindirubin-3'-oxime  (ISO)
6-chloro-2,3,4,9-tetrahydro-1H-carbazole-1-carboxamide  (ISO)
6-propyl-2-thiouracil  (ISO)
7,12-dimethyltetraphene  (ISO)
8'-apo-beta,psi-caroten-8'-al  (ISO)
8-Br-cAMP  (ISO)
9-cis-retinoic acid  (ISO)
[6]-Shogaol  (ISO)
Ac-Ser-Asp-Lys-Pro-OH  (ISO)
acadesine  (ISO)
acetylsalicylic acid  (ISO)
acrolein  (ISO)
acrylonitrile  (ISO)
acteoside  (ISO)
adenine  (EXP,ISO)
afimoxifene  (ISO)
aflatoxin B1  (ISO)
aldehydo-D-glucose  (ISO)
aldosterone  (ISO)
aldrin  (ISO)
all-trans-4-oxoretinoic acid  (ISO)
all-trans-4-oxoretinol  (ISO)
all-trans-retinoic acid  (EXP,ISO)
all-trans-retinol  (ISO)
allopurinol  (ISO)
alpha-naphthoflavone  (ISO)
alpha-pinene  (ISO)
aluminium atom  (ISO)
aluminium(0)  (ISO)
AM-251  (ISO)
ametryn  (EXP)
amiodarone  (ISO)
ammonium chloride  (EXP)
andrographolide  (ISO)
anthocyanin  (EXP)
anthra[1,9-cd]pyrazol-6(2H)-one  (ISO)
antroquinonol  (ISO)
arecoline  (ISO)
aristolochic acid A  (ISO)
aristolochic acids  (ISO)
Aroclor 1254  (ISO)
arsane  (ISO)
arsenic atom  (ISO)
arsenite(3-)  (EXP,ISO)
arsenous acid  (ISO)
aspartame  (ISO)
atorvastatin  (ISO)
atorvastatin calcium  (EXP)
atrazine  (EXP)
aucubin  (ISO)
Azaspiracid  (ISO)
bafilomycin A1  (ISO)
belinostat  (ISO)
benzo[a]pyrene  (EXP,ISO)
benzo[b]fluoranthene  (ISO)
benzophenanthridine  (ISO)
berberine  (ISO)
beta-carotene  (ISO)
beta-lapachone  (ISO)
bicalutamide  (ISO)
bis(2-ethylhexyl) phthalate  (ISO)
bisphenol A  (EXP,ISO)
bisphenol F  (ISO)
blebbistatin  (ISO)
bleomycin A2  (EXP,ISO)
bosutinib  (ISO)
bromodichloromethane  (EXP)
butan-1-ol  (ISO)
butanal  (ISO)
butein  (ISO)
Butylbenzyl phthalate  (ISO)
C.I. Natural Red 20  (ISO)
cadmium atom  (EXP,ISO)
cadmium dichloride  (EXP,ISO)
caffeine  (EXP,ISO)
Calcimycin  (ISO)
calcitriol  (ISO)
cannabidiol  (ISO)
cantharidin  (ISO)
capsaicin  (ISO)
captopril  (ISO)
carbamazepine  (ISO)
carbon nanotube  (ISO)
carboxy-PTIO  (ISO)
carvedilol  (EXP)
celecoxib  (ISO)
CHIR 99021  (ISO)
chlordecone  (ISO)
chlorogenic acid  (ISO)
chloropicrin  (ISO)
chloroquine  (EXP)
chlorpyrifos  (ISO)
choline  (ISO)
chromium(6+)  (ISO)
chrysene  (ISO)
chrysin  (ISO)
ciglitazone  (EXP,ISO)
ciguatoxin CTX1B  (ISO)
Cirsimarin  (ISO)
cisatracurium  (ISO)
cisplatin  (ISO)
clofibrate  (ISO)
cobalt dichloride  (ISO)
cocaine  (ISO)
colforsin daropate hydrochloride  (ISO)
copper atom  (ISO)
copper(0)  (ISO)
copper(II) chloride  (ISO)
copper(II) sulfate  (ISO)
cordycepin  (ISO)
coumarin  (ISO)
crocidolite asbestos  (ISO)
Cryptotanshinone  (ISO)
curcumin  (ISO)
cyclophosphamide  (EXP)
cyclosporin A  (ISO)
cyhalothrin  (ISO)
cyprodinil  (ISO)
cytochalasin D  (ISO)
D-glucose  (ISO)
dapagliflozin  (EXP)
DAPT  (ISO)
DDE  (ISO)
DDT  (ISO)
deguelin  (ISO)
delphinidin  (ISO)
deoxycholic acid  (ISO)
desipramine  (ISO)
Destruxin B  (ISO)
dexamethasone  (EXP,ISO)
dextran sulfate  (ISO)
Di-n-octyl phthalate  (ISO)
diallyl disulfide  (ISO)
diallyl trisulfide  (ISO)
diarsenic trioxide  (ISO)
dibenz[a,h]anthracene  (ISO)
dibenzo[a,l]pyrene  (ISO)
dibutyl phthalate  (EXP,ISO)
dichloroacetic acid  (ISO)
dichloromethane  (ISO)
diclofenac  (EXP,ISO)
Dictamnine  (ISO)
dieckol  (ISO)
diethyl phthalate  (ISO)
Diisodecyl phthalate  (ISO)
diisononyl phthalate  (ISO)
dimethyl sulfoxide  (EXP,ISO)
dimethylarsinic acid  (EXP)
Diosbulbin B  (ISO)
dioxygen  (ISO)
divanadium pentaoxide  (ISO)
dorsomorphin  (ISO)
doxorubicin  (ISO)
embelin  (ISO)
emodin  (EXP)
endosulfan  (EXP,ISO)
entinostat  (ISO)
eplerenone  (ISO)
epoxiconazole  (ISO)
epoxomicin  (ISO)
ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-one  (ISO)
erlotinib hydrochloride  (EXP,ISO)
ethanol  (ISO)
everolimus  (ISO)
fenbendazole  (ISO)
fenthion  (ISO)
ferric oxide  (EXP,ISO)
ferrostatin-1  (ISO)
ferulic acid  (ISO)
finasteride  (EXP)
fisetin  (ISO)
flubendazole  (ISO)
fludioxonil  (ISO)
fluoranthene  (ISO)
folic acid  (ISO)
formaldehyde  (ISO)
FR900359  (ISO)
fructose  (EXP)
fulvestrant  (ISO)
furan  (EXP)
gamma-aminobutyric acid  (ISO)
gefitinib  (ISO)
geldanamycin  (ISO)
gemcitabine  (ISO)
genistein  (EXP,ISO)
gentamycin  (EXP)
geraniol  (EXP)
Ginkgoic acid  (ISO)
ginsenoside Rg1  (ISO)
glabridin  (ISO)
glucose  (ISO)
glycidol  (EXP)
glycidyl methacrylate  (ISO)
glycyrrhizinic acid  (ISO)
glyphosate  (ISO)
goralatide  (ISO)
GW 4064  (ISO)
harmaline  (ISO)
hemin  (EXP)
heptachlor  (ISO)
hexachlorobenzene  (EXP)
Honokiol  (ISO)
hydrogen peroxide  (ISO)
hydroxyflutamide  (ISO)
imidacloprid  (ISO)
indole-3-methanol  (EXP)
indometacin  (ISO)
inulin  (ISO)
iprodione  (ISO)
irinotecan  (ISO)
isobutanol  (ISO)
isoorientin  (ISO)
isopimaric acid  (ISO)
isoprene  (ISO)
isorhamnetin  (ISO)
Isorhapontigenin  (ISO)
ivermectin  (ISO)
jaspamide  (ISO)
ketamine  (EXP,ISO)
L-1,4-dithiothreitol  (ISO)
L-methionine  (ISO)
lapatinib  (ISO)
latrunculin A  (ISO)
lead diacetate  (ISO)
leupeptin  (EXP)
limonin  (ISO)
linalool  (ISO)
lipopolysaccharide  (ISO)
liraglutide  (ISO)
lithium atom  (EXP)
lithium chloride  (ISO)
lithium hydride  (EXP)
lithocholic acid  (ISO)
loliolide  (ISO)
losartan  (ISO)
lupeol  (ISO)
luteolin  (ISO)
LY294002  (ISO)
mangiferin  (ISO)
masoprocol  (ISO)
mebendazole  (ISO)
melittin  (ISO)
menadione  (ISO)
mercury atom  (ISO)
mercury dibromide  (ISO)
mercury(0)  (ISO)
metformin  (ISO)
methotrexate  (ISO)
methoxyacetic acid  (EXP)
methoxychlor  (EXP)
methylarsonic acid  (EXP)
methylmercury chloride  (EXP,ISO)
microcystin-LR  (ISO)
mifepristone  (ISO)
mithramycin  (ISO)
MK-2206  (ISO)
ML-7  (ISO)
Monobutylphthalate  (EXP)
monocrotaline  (ISO)
monosodium L-glutamate  (ISO)
morusin  (ISO)
Muraglitazar  (EXP)
N(6),N(6)-dimethyladenine  (EXP)
N(gamma)-nitro-L-arginine methyl ester  (ISO)
N,N,N',N'-tetrakis(2-pyridylmethyl)ethylenediamine  (ISO)
N-acetyl-L-cysteine  (ISO)
N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine  (EXP)
N-methyl-N-nitrosourea  (EXP,ISO)
N-nitrosodiethylamine  (ISO)
neomycin  (ISO)
nickel atom  (ISO)
nickel dichloride  (ISO)
nickel sulfate  (ISO)
niclosamide  (ISO)
nicotine  (ISO)
nitric oxide  (ISO)
nitrofen  (EXP)
Nonylphenol  (ISO)
O-methyleugenol  (ISO)
ochratoxin A  (EXP,ISO)
okadaic acid  (ISO)
Ophiopogonin D  (ISO)
oridonin  (ISO)
Osajin  (ISO)
ouabain  (ISO)
oxaliplatin  (EXP,ISO)
ozone  (ISO)
p-chloromercuribenzoic acid  (ISO)
p-menthan-3-ol  (ISO)
p-tert-Amylphenol  (ISO)
Pachymic acid  (ISO)
paclitaxel  (ISO)
palbociclib  (ISO)
panobinostat  (ISO)
paracetamol  (EXP,ISO)
paraquat  (EXP,ISO)
parecoxib  (ISO)
patulin  (EXP)
pelargonidin  (ISO)
perfluorohexanesulfonic acid  (ISO)
perfluorooctane-1-sulfonic acid  (EXP,ISO)
perfluorooctanoic acid  (ISO)
phenobarbital  (ISO)
phenol red  (ISO)
phenylmercury acetate  (ISO)
PhIP  (ISO)
phorbol 13-acetate 12-myristate  (ISO)
pifithrin-?  (ISO)
pinostrobin  (ISO)
pirfenidone  (EXP,ISO)
pirinixic acid  (ISO)
plerixafor  (ISO)
poly(guanylic acid)  (EXP)
poly(I:C)  (ISO)
Pomiferin  (ISO)
potassium iodide  (EXP)
procyanidin B2  (ISO)
procymidone  (ISO)
propiconazole  (EXP,ISO)
propofol  (ISO)
prostaglandin E2  (ISO)
pterostilbene  (ISO)
puerarin  (ISO)
pyrrolidine dithiocarbamate  (ISO)
quartz  (ISO)
quercetin  (EXP,ISO)
quercitrin  (ISO)
quinolin-8-ol  (ISO)
rac-lactic acid  (ISO)
radon atom  (ISO)
radon(0)  (ISO)
reactive oxygen species  (ISO)
reparixin  (ISO)
resveratrol  (ISO)
RGFP966  (ISO)
ridaforolimus  (ISO)
rolipram  (ISO)
rotenone  (ISO)
rottlerin  (ISO)
ruxolitinib  (ISO)
S-allylcysteine  (ISO)
Salinomycin  (ISO)
salubrinal  (ISO)
sanguinarine  (ISO)
SB 203580  (ISO)
SB 290157  (ISO)
SB 431542  (ISO)
Selamectin  (ISO)
serpentine asbestos  (ISO)
sevoflurane  (ISO)
Shikonin  (ISO)
silicon dioxide  (EXP,ISO)
silver atom  (ISO)
silver(0)  (ISO)
Sinomenine  (ISO)
sirolimus  (EXP,ISO)
sodium arsenate  (ISO)
sodium arsenite  (ISO)
sodium dichromate  (ISO)
solasodine  (ISO)
Sophoricoside  (ISO)
sorafenib  (ISO)
sorbinil  (ISO)
stattic  (ISO)
streptozocin  (EXP)
sulfasalazine  (ISO)
sulforaphane  (EXP,ISO)
sulindac sulfide  (ISO)
Swertiamarin  (EXP)
syringin  (ISO)
tacrolimus hydrate  (ISO)
tamoxifen  (ISO)
Tanshinone I  (ISO)
taraxasterol  (ISO)
teprenone  (ISO)
Tesaglitazar  (EXP)
testosterone  (EXP)
tetrachloromethane  (EXP,ISO)
tetraethylenepentamine  (ISO)
tetraphene  (ISO)
thalidomide  (ISO)
theaflavin  (ISO)
thioacetamide  (EXP)
thymoquinone  (ISO)
Tiron  (ISO)
titanium dioxide  (ISO)
tolfenamic acid  (ISO)
toluene 2,4-diisocyanate  (ISO)
topotecan  (EXP,ISO)
trichloroethene  (ISO)
trichostatin A  (ISO)
triclosan  (ISO)
trimethylarsine oxide  (EXP)
triphenyl phosphate  (ISO)
triptonide  (ISO)
tris(2-butoxyethyl) phosphate  (ISO)
troglitazone  (EXP,ISO)
Tubeimoside II  (ISO)
tunicamycin  (ISO)
tyrphostin AG 1478  (ISO)
ubiquinone-0  (ISO)
undecane  (EXP)
urethane  (ISO)
ursodeoxycholic acid  (EXP)
valproic acid  (EXP,ISO)
verapamil  (ISO)
vinclozolin  (EXP)
vincristine  (ISO)
vinyl carbamate  (ISO)
vorinostat  (ISO)
vortioxetine  (ISO)
warfarin  (ISO)
wortmannin  (ISO)
XAV939  (ISO)
Y-27632  (EXP,ISO)
Yessotoxin  (ISO)
zearalenone  (ISO)
zinc atom  (ISO)
zinc(0)  (ISO)