Nr1i2 (nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Nr1i2 (nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2) Rattus norvegicus
Analyze
Symbol: Nr1i2
Name: nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2
RGD ID: 69057
Description: Enables nuclear receptor activity. Predicted to be involved in several processes, including cellular response to type I interferon; regulation of transcription by RNA polymerase II; and xenobiotic transport. Predicted to act upstream of or within negative regulation of DNA-templated transcription and positive regulation of gene expression. Predicted to be located in intermediate filament cytoskeleton and nuclear body. Predicted to be part of transcription regulator complex. Biomarker of cholestasis and epilepsy. Orthologous to human NR1I2 (nuclear receptor subfamily 1 group I member 2); INTERACTS WITH (+)-schisandrin B; (+)-trans-(S)-allethrin; (3-phenoxyphenyl)methanol.
Type: protein-coding
RefSeq Status: VALIDATED
Previously known as: MGC108643; nuclear receptor subfamily 1 group I member 2; nuclear receptor subfamily 1, group 1, member 2; orphan nuclear receptor PXR; pregnane X receptor (nuclear receptor sub family 1, group I, member 2); PXR
RGD Orthologs
Human
Mouse
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Genes
More Info more info ...
Allele / Splice: Nr1i2em1Sage  
Genetic Models: SD-Nr1i2em1Sage SD-Nr1i2em1Sage Nr1i3em1Sage SD-Nr1i2em1Sage Nr1i3em1Sage Ahrem1Sage
Latest Assembly: mRatBN7.2 - mRatBN7.2 Assembly
Position:
Rat AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCr81175,965,717 - 76,006,733 (+)NCBIGRCr8
mRatBN7.21162,460,213 - 62,496,665 (+)NCBImRatBN7.2mRatBN7.2
mRatBN7.2 Ensembl1162,460,213 - 62,496,658 (+)EnsemblmRatBN7.2 Ensembl
UTH_Rnor_SHR_Utx1171,272,711 - 71,309,163 (+)NCBIRnor_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.01163,934,940 - 63,971,386 (+)NCBIRnor_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.01162,985,406 - 63,021,853 (+)NCBIRnor_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
Rnor_6.01165,022,100 - 65,058,546 (+)NCBIRnor6.0Rnor_6.0rn6Rnor6.0
Rnor_6.0 Ensembl1165,022,100 - 65,058,545 (+)EnsemblRnor6.0rn6Rnor6.0
Rnor_5.01167,024,185 - 67,060,494 (-)NCBIRnor5.0Rnor_5.0rn5Rnor5.0
RGSC_v3.41164,239,918 - 64,276,702 (+)NCBIRGSC3.4RGSC_v3.4rn4RGSC3.4
RGSC_v3.11164,297,534 - 64,333,716 (+)NCBI
Celera1161,960,674 - 61,997,009 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map11q21NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Gene-Chemical Interaction Annotations     Click to see Annotation Detail View
(+)-artemisinin  (ISO)
(+)-catechin  (ISO)
(+)-schisandrin B  (EXP,ISO)
(+)-trans-(S)-allethrin  (EXP,ISO)
(-)-secoisolariciresinol  (ISO)
(3-phenoxyphenyl)methanol  (EXP,ISO)
(E,E)-germacrone  (ISO)
(R,R,R)-alpha-tocopherol  (ISO)
(S)-naringenin  (ISO)
(Z)-ligustilide  (ISO)
1,1,1-trichloro-2,2-bis(4-hydroxyphenyl)ethane  (ISO)
1,1,1-Trichloro-2-(o-chlorophenyl)-2-(p-chlorophenyl)ethane  (EXP,ISO)
1,1-dichloroethene  (ISO)
1,2-dichloroethane  (ISO)
1-(3-chlorophenyl)piperazine  (ISO)
1-\{2-[(4-chlorobenzyl)sulfanyl]-2-(2,4-dichlorophenyl)ethyl\}-1H-imidazole  (ISO)
1-Hydroxypyrene  (ISO)
1-naphthol  (EXP)
1-naphthyl isothiocyanate  (EXP,ISO)
10H-phenothiazine  (ISO)
13-cis-retinal  (ISO)
17alpha-ethynylestradiol  (EXP,ISO)
17alpha-hydroxyprogesterone  (ISO)
17beta-estradiol  (ISO)
17beta-hydroxy-5alpha-androstan-3-one  (EXP,ISO)
1H-indole  (ISO)
2,2',4,4',5,5'-hexachlorobiphenyl  (EXP,ISO)
2,2',4,4'-Tetrabromodiphenyl ether  (ISO)
2,2',4,4'-tetrachlorobiphenyl  (ISO)
2,2',5,5'-tetrachlorobiphenyl  (EXP)
2,2'-Bisphenol F  (ISO)
2,2-diphenylacetic acid 2-(diethylamino)ethyl ester  (ISO)
2,3',4,4',5-Pentachlorobiphenyl  (ISO)
2,3,3',4,4',5,5'-Heptachlorobiphenyl  (ISO)
2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine  (EXP,ISO)
2,4,5-trichlorophenol  (ISO)
2,4,6-trinitrobenzenesulfonic acid  (ISO)
2,4-D  (ISO)
2,4-dibromophenyl 2,4,5-tribromophenyl ether  (ISO)
2,4-Dihydroxybenzophenone  (ISO)
2,5-di-tert-butylbenzene-1,4-diol  (ISO)
2,8-bis-Trifluoromethyl-4-quinoline carboxylic acid  (ISO)
2-(1-naphthalenylmethyl)-3-(2-oxolanyl)propanoic acid 2-(diethylamino)ethyl ester  (ISO)
2-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-\{[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl](methyl)amino\}-2-(propan-2-yl)pentanenitrile  (ISO)
2-acetamidofluorene  (EXP,ISO)
2-benzyl-4-chlorophenol  (ISO)
2-butan-2-yl-4-[4-[4-[4-[[2-(2,4-dichlorophenyl)-2-(1,2,4-triazol-1-ylmethyl)-1,3-dioxolan-4-yl]methoxy]phenyl]-1-piperazinyl]phenyl]-1,2,4-triazol-3-one  (ISO)
2-methyl-1H-indole  (ISO)
2-tert-butylhydroquinone  (ISO)
3,3',4,4',5-pentachlorobiphenyl  (ISO)
3,3',4,4'-tetrachlorobiphenyl  (ISO)
3,3',5,5'-tetrabromobisphenol A  (ISO)
3,3',5,5'-tetraiodothyroacetic acid  (ISO)
3,3',5-triiodo-L-thyronine  (ISO)
3,3'-diindolylmethane  (ISO)
3,3'-Dimethylbenzidine  (ISO)
3,4-methylenedioxymethamphetamine  (EXP,ISO)
3,5-xylenol  (ISO)
3-iodoprop-2-yn-1-yl butylcarbamate  (ISO)
3-Methyl-4-(2,6,6-trimethyl-2-cyclohexen-1-yl)-3-buten-2-one  (ISO)
3-oxo-5beta-cholanic acid  (ISO)
4'-epidoxorubicin  (ISO)
4,4'-diaminodiphenylmethane  (ISO)
4,4'-sulfonyldiphenol  (ISO)
4-(5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,5-a]pyridin-5-yl)benzonitrile  (ISO)
4-chloro-3,5-dimethylphenol  (ISO)
4-hydroxy-3-(2-hydroxy-3-oxo-1-phenylbutyl)-2H-chromen-2-one  (ISO)
4-hydroxy-3-[1-(4-hydroxyphenyl)-3-oxobutyl]-2H-chromen-2-one  (ISO)
4-hydroxyphenyl retinamide  (ISO)
4-Methyl-3-penten-2-one, 9CI  (ISO)
4-nonylphenol  (EXP,ISO)
4-octylphenol  (ISO)
4-tert-butylphenol  (ISO)
4-tert-Octylphenol  (ISO)
5,7-dihydroxy-4'-methoxyflavone  (ISO)
5-aza-2'-deoxycytidine  (ISO)
5-iodo-2'-deoxyuridine  (ISO)
5-methoxy-2-\{[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]sulfinyl\}-1H-benzimidazole  (EXP,ISO)
5alpha-pregnane-3,20-dione  (ISO)
6-(4-chlorophenyl)imidazo[2,1-b][1,3]thiazole-5-carbaldehyde O-(3,4-dichlorobenzyl)oxime  (ISO)
6-propyl-2-thiouracil  (EXP,ISO)
7,12-dimethyltetraphene  (ISO)
8-(4-chlorophenylthio)-cAMP  (ISO)
8-Br-cAMP  (ISO)
9-cis-retinal  (ISO)
9-cis-retinoic acid  (ISO)
9-phenanthrol  (ISO)
acetamide  (EXP)
acetochlor  (ISO)
Acetyl tributyl citrate  (EXP,ISO)
aconitine  (ISO)
actinomycin D  (EXP,ISO)
adenine arabinoside  (ISO)
afimoxifene  (ISO)
aflatoxin B1  (ISO)
Aflatoxin B2 alpha  (ISO)
Aflatoxin G1  (ISO)
aflatoxin M1  (ISO)
alachlor  (EXP,ISO)
aldehydo-D-glucose  (ISO)
aldrin  (ISO)
all-trans-retinoic acid  (ISO)
allethrin  (EXP)
allyl isothiocyanate  (EXP,ISO)
alpha-hexachlorocyclohexane  (ISO)
alpha-santonin  (ISO)
alpha-tocotrienol  (ISO)
aminoglutethimide  (ISO)
amiodarone  (ISO)
ammonium chloride  (EXP,ISO)
amphetamine  (ISO)
amprenavir  (ISO)
androst-4-ene-3,17-dione  (ISO)
androstane  (ISO)
angiotensin II  (ISO)
Anilofos  (ISO)
apazone  (ISO)
apigenin  (ISO)
arsenite(3-)  (EXP)
atazanavir sulfate  (ISO)
atorvastatin calcium  (EXP,ISO)
atrazine  (ISO)
azinphos-methyl  (ISO)
azoxystrobin  (ISO)
beclomethasone  (ISO)
Benfuresate  (ISO)
benidipine  (ISO)
bensulfuron-methyl  (ISO)
Bensulide  (ISO)
benzo[a]pyrene  (ISO)
benzo[a]pyrene diol epoxide I  (ISO)
Benzo[a]pyrene-7,8-diol  (ISO)
benzo[c]phenanthrene  (ISO)
benzophenone  (EXP)
Benzyl parahydroxybenzoate  (ISO)
berberine  (ISO)
bergomottin  (ISO)
Besigomsin  (ISO)
beta-carotene  (ISO)
beta-hexachlorocyclohexane  (ISO)
beta-naphthoflavone  (EXP,ISO)
beta-tocotrienol  (ISO)
bezafibrate  (ISO)
bicalutamide  (ISO)
bifenthrin  (EXP,ISO)
bilirubin IXalpha  (ISO)
biochanin A  (ISO)
bioresmethrin  (EXP,ISO)
biphenyl-2-ol  (ISO)
biphenyl-4-ol  (ISO)
bis(2-ethylhexyl) phthalate  (EXP,ISO)
bisphenol A  (EXP,ISO)
Bisphenol A diglycidyl ether  (ISO)
bisphenol A dimethacrylate  (ISO)
Bisphenol B  (ISO)
bitertanol  (ISO)
brefeldin A  (ISO)
Bromadiolone  (ISO)
bromocresol purple  (ISO)
Bromophos-ethyl  (ISO)
bromothymol blue  (ISO)
Bromperidol  (ISO)
bromuconazole  (EXP,ISO)
budesonide  (EXP,ISO)
bupirimate  (ISO)
buspirone  (EXP)
buta-1,3-diene  (ISO)
butafenacil  (ISO)
Butamifos  (ISO)
butein  (ISO)
butoconazole  (ISO)
butylated hydroxyanisole  (ISO)
Butylbenzyl phthalate  (ISO)
Butylparaben  (EXP,ISO)
cafenstrole  (ISO)
calcitriol  (ISO)
camptothecin  (ISO)
captan  (ISO)
carbamazepine  (EXP,ISO)
carbamazepine-10,11-epoxide  (ISO)
carbaryl  (EXP,ISO)
carbon nanotube  (ISO)
cerivastatin  (ISO)
cetylpyridinium  (ISO)
chenodeoxycholic acid  (ISO)
CHIR 99021  (ISO)
Chlomethoxyfen  (ISO)
chlordecone  (ISO)
chlorfenvinfos  (ISO)
chlornitrofen  (ISO)
Chlorobenzilate  (ISO)
Chloromethyl methyl ether  (ISO)
chloropropylate  (ISO)
chlorothalonil  (ISO)
chlorpromazine  (ISO)
chlorpropham  (ISO)
chlorpyrifos  (ISO)
chlorpyrifos-methyl  (ISO)
cholesterol  (ISO)
cholic acid  (ISO)
choline  (ISO)
chrysin  (ISO)
ciguatoxin CTX1B  (ISO)
cimetidine  (ISO)
cinchocaine  (ISO)
cisplatin  (ISO)
clemizole  (ISO)
clobetasol  (ISO)
clofibrate  (EXP,ISO)
clomiphene  (ISO)
clonazepam  (ISO)
clorgyline  (ISO)
clotrimazole  (EXP,ISO)
clozapine  (ISO)
cobicistat  (ISO)
colforsin daropate hydrochloride  (EXP,ISO)
copper(II) sulfate  (ISO)
corticosterone  (ISO)
coumaphos  (ISO)
coumestrol  (ISO)
Cryptotanshinone  (ISO)
Cuprizon  (EXP)
curcumin  (ISO)
Cyanofenphos  (ISO)
cyclophosphamide  (ISO)
cyclosporin A  (ISO)
cyfluthrin  (EXP,ISO)
cyhalothrin  (EXP,ISO)
cypermethrin  (EXP,ISO)
cyproconazole  (ISO)
cyprodinil  (ISO)
cyproterone acetate  (ISO)
D-glucose  (ISO)
daidzein  (ISO)
DDD  (ISO)
DDE  (EXP,ISO)
DDT  (ISO)
decabromodiphenyl ether  (EXP,ISO)
Decamethylcyclopentasiloxane  (ISO)
dehydroepiandrosterone  (ISO)
delta-hexachlorocyclohexane  (ISO)
delta-tocotrienol  (ISO)
deoxycholic acid  (ISO)
Deoxyschizandrin  (ISO)
dexamethasone  (EXP,ISO)
dextran sulfate  (ISO)
diazepam  (ISO)
diazinon  (ISO)
dibenzo[a,l]pyrene  (ISO)
dibutyl phthalate  (EXP,ISO)
Dichlofenthion  (ISO)
diclofenac  (ISO)
dicloxacillin  (ISO)
dicofol  (ISO)
Dicyclohexyl phthalate  (ISO)
dieldrin  (EXP,ISO)
diethyl phthalate  (ISO)
diethylstilbestrol  (ISO)
difenoconazole  (ISO)
diflubenzuron  (ISO)
dihydroergotamine  (ISO)
diisobutyl phthalate  (ISO)
Diisodecyl phthalate  (ISO)
diisononyl phthalate  (ISO)
dilazep  (ISO)
dimethomorph  (ISO)
dimethylarsinous acid  (ISO)
diniconazole  (ISO)
diosgenin  (ISO)
dioxygen  (ISO)
dipentyl phthalate  (ISO)
Diphenolic acid  (ISO)
diphenylamine  (ISO)
diquat  (ISO)
disopyramide  (ISO)
disulfiram  (ISO)
disulfoton  (ISO)
Dithiopyr  (ISO)
diuron  (ISO)
dodecylamine  (ISO)
doxorubicin  (ISO)
econazole  (ISO)
efavirenz  (EXP)
endosulfan  (EXP,ISO)
endrin  (ISO)
enilconazole  (ISO)
Enterolactone  (ISO)
EPN  (ISO)
epoxiconazole  (ISO)
equilin  (ISO)
erlotinib hydrochloride  (ISO)
estriol  (ISO)
estrone  (ISO)
Ethalfluralin  (ISO)
ethanol  (EXP,ISO)
ethion  (ISO)
ethoprophos  (ISO)
ethotoin  (ISO)
ethoxyquin  (ISO)
ethylparaben  (EXP,ISO)
eticlopride(1+)  (ISO)
etidronic acid  (ISO)
etofenprox  (ISO)
etoposide  (ISO)
eugenol  (ISO)
farglitazar  (ISO)
felodipine  (EXP,ISO)
fenamiphos  (ISO)
fenarimol  (ISO)
fenbuconazole  (ISO)
fenhexamid  (ISO)
fenitrothion  (ISO)
fenofibrate  (ISO)
fenthion  (ISO)
fentin chloride  (ISO)
fenvalerate  (EXP,ISO)
Fexofenadine hydrochloride  (ISO)
finasteride  (ISO)
fipronil  (ISO)
fisetin  (ISO)
flavonol  (EXP,ISO)
fluconazole  (ISO)
flucythrinate  (ISO)
fludioxonil  (ISO)
flufenacet  (ISO)
Flumetralin  (ISO)
flunisolide  (ISO)
fluoranthene  (ISO)
flutamide  (EXP,ISO)
fluticasone  (ISO)
flutolanil  (ISO)
fluvalinate  (ISO)
fluvastatin  (ISO)
folic acid  (ISO)
folpet  (ISO)
fulvestrant  (ISO)
galangin  (ISO)
gamma-hexachlorocyclohexane  (EXP,ISO)
genistein  (EXP,ISO)
Ginkgolide A  (ISO)
ginkgolide B  (ISO)
glimepiride  (ISO)
glucose  (ISO)
glycochenodeoxycholic acid  (ISO)
glycocholic acid  (ISO)
glycodeoxycholic acid  (ISO)
glycyrrhizinic acid  (ISO)
guggulsterone  (ISO)
GW 4064  (ISO)
heptachlor  (ISO)
Heptachlor epoxide  (ISO)
hesperetin  (ISO)
hexestrol  (ISO)
hycanthone  (ISO)
Hydrastine  (ISO)
hydroxyflutamide  (ISO)
hydroxyitraconazole  (ISO)
Hypaconitine  (ISO)
hyperforin  (ISO)
ifosfamide  (ISO)
Ile(5)-angiotensin II  (ISO)
imazamox  (ISO)
imipenem hydrate  (ISO)
Indanofan  (ISO)
indole-3-acetamide  (ISO)
indoprofen  (ISO)
iprobenfos  (ISO)
iprodione  (ISO)
irinotecan  (ISO)
Isobutylparaben  (EXP,ISO)
Isoetharine  (ISO)
isofenphos  (ISO)
isoliquiritigenin  (ISO)
isopimpinellin  (ISO)
isoprothiolane  (ISO)
isoproturon  (ISO)
isorhamnetin  (ISO)
isotretinoin  (ISO)
isoxaben  (ISO)
isoxazoles  (ISO)
Isradipine  (ISO)
itraconazole  (ISO)
kaempferol  (ISO)
ketoconazole  (ISO)
kojic acid  (EXP)
L-methionine  (ISO)
lansoprazole  (ISO)
leflunomide  (ISO)
leptophos  (ISO)
levonorgestrel  (ISO)
lidocaine  (ISO)
lignan  (ISO)
linuron  (ISO)
lipopolysaccharide  (ISO)
lithocholic acid  (EXP,ISO)
loperamide  (ISO)
lovastatin  (ISO)
lycopene  (ISO)
Maleic hydrazide  (ISO)
MC-4379  (ISO)
mecarbam  (ISO)
Medazepam  (ISO)
medroxyprogesterone acetate  (ISO)
mefenacet  (ISO)
mefenamic acid  (ISO)
megestrol  (ISO)
melatonin