Bdnf (brain derived neurotrophic factor) - Rat Genome Database

Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Gene: Bdnf (brain derived neurotrophic factor) Mus musculus
Analyze
Symbol: Bdnf
Name: brain derived neurotrophic factor
RGD ID: 10235
MGI Page MGI
Description: Predicted to enable growth factor activity; nerve growth factor receptor binding activity; and neurotrophin TRKB receptor binding activity. Involved in several processes, including negative regulation of apoptotic signaling pathway; positive regulation of neuron projection development; and trans-synaptic signaling, modulating synaptic transmission. Acts upstream of or within several processes, including modulation of chemical synaptic transmission; neuron differentiation; and regulation of neurogenesis. Located in several cellular components, including dendrite; perinuclear region of cytoplasm; and secretory granule. Is active in glutamatergic synapse; hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; and neuronal dense core vesicle. Is expressed in several structures, including alimentary system; central nervous system; genitourinary system; respiratory system; and sensory organ. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including cocaine dependence; cognitive disorder (multiple); congenital central hypoventilation syndrome; neurodegenerative disease (multiple); and obstructive sleep apnea. Orthologous to human BDNF (brain derived neurotrophic factor).
Type: protein-coding
RefSeq Status: REVIEWED
Previously known as: anorexia BDNF; brain-derived neurotrophic factor
RGD Orthologs
Human
Rat
Chinchilla
Bonobo
Dog
Squirrel
Pig
Green Monkey
Naked Mole-Rat
Alliance Genes
More Info more info ...
Latest Assembly: GRCm39 - Mouse Genome Assembly GRCm39
Position:
Mouse AssemblyChrPosition (strand)SourceGenome Browsers
JBrowseNCBIUCSCEnsembl
GRCm392109,505,045 - 109,557,388 (+)NCBIGRCm39GRCm39mm39
GRCm39 Ensembl2109,505,045 - 109,557,352 (+)EnsemblGRCm39 Ensembl
GRCm382109,674,700 - 109,727,043 (+)NCBIGRCm38GRCm38mm10GRCm38
GRCm38.p6 Ensembl2109,674,700 - 109,727,007 (+)EnsemblGRCm38mm10GRCm38
MGSCv372109,514,857 - 109,567,200 (+)NCBIGRCm37MGSCv37mm9NCBIm37
MGSCv362109,475,539 - 109,527,845 (+)NCBIMGSCv36mm8
Celera2110,835,441 - 110,887,723 (+)NCBICelera
Cytogenetic Map2E3NCBI
cM Map256.63NCBI
JBrowse: View Region in Genome Browser (JBrowse)
Model


Disease Annotations     Click to see Annotation Detail View
acoustic neuroma  (ISO)
alcohol dependence  (ISO)
alcohol use disorder  (IEP,ISO)
Alcohol-Related Disorders  (ISO)
Alcoholic Intoxication  (IEP)
alopecia  (ISO)
Alzheimer's disease  (ISO)
amnestic disorder  (IEP,ISO)
amphetamine abuse  (ISO)
Amyloid Plaques  (IEP)
anxiety disorder  (ISO)
asthma  (ISO)
Ataxia  (IMP)
atopic dermatitis  (ISO)
attention deficit hyperactivity disorder  (ISO)
autism spectrum disorder  (ISO)
autistic disorder  (ISO)
bacterial meningitis  (IEP,ISO)
bipolar disorder  (ISO)
Body Weight  (ISO)
borna disease  (ISO)
Brain Injuries  (IEP,ISO)
brain ischemia  (ISO)
Cerebral Hemorrhage  (ISO)
Chronic Pain  (ISO)
cocaine dependence  (ISO)
Cocaine-Related Disorders  (ISO)
cognitive disorder  (ISO)
colitis  (IEP)
color blindness  (ISO)
congenital central hypoventilation syndrome  (ISO)
cystitis  (ISO)
Deafness  (IDA,ISO)
depressive disorder  (ISO)
Diabetic Nephropathies  (ISO)
diabetic neuropathy  (ISO)
diabetic retinopathy  (ISO)
Drug Eruptions  (IEP)
epilepsy  (ISO)
epilepsy with generalized tonic-clonic seizures  (ISO)
Experimental Autoimmune Encephalomyelitis  (ISO)
Experimental Diabetes Mellitus  (ISO)
focal epilepsy  (ISO)
Frontotemporal Lobar Degeneration  (ISO)
genetic disease  (ISO)
glaucoma  (ISO)
Gliosis  (ISO)
Hearing Loss  (ISO)
Hearing Loss, Noise-Induced  (IEP,IMP,ISO)
heroin dependence  (ISO)
Huntington's disease  (IEP,ISO)
Hyperalgesia  (IMP,ISO)
Hyperoxia  (ISO)
hypertensive encephalopathy  (ISO)
hypothyroidism  (ISO)
Hypoxia  (ISO)
Inflammation  (IEP,ISO)
inner ear disease  (ISO)
intellectual disability  (ISO)
intermediate coronary syndrome  (ISO)
interstitial lung disease  (ISO)
Intervertebral Disc Displacement  (ISO)
irritable bowel syndrome  (ISO)
keratoconus  (ISO)
Leukoencephalopathies  (ISO)
low tension glaucoma  (ISO)
major depressive disorder  (ISO)
Memory Disorders  (IEP,ISO)
Metabolic Syndrome  (ISO)
middle cerebral artery infarction  (ISO)
morbid obesity  (ISO)
morphine dependence  (IEP,ISO)
morphine withdrawal syndrome  (ISO)
multiple sclerosis  (ISO)
Nasal Polyps  (ISO)
neovascular inflammatory vitreoretinopathy  (ISO)
Nerve Degeneration  (ISO)
Nerve Injuries  (ISO)
nervous system disease  (ISO)
nicotine dependence  (ISO)
obesity  (ISO)
obsessive-compulsive disorder  (ISO)
obstructive sleep apnea  (ISO)
Optic Nerve Injuries  (IDA,ISO)
Pain  (ISO)
Parkinson's disease  (ISO)
Parkinsonism  (ISO)
Peripheral Nerve Injuries  (IEP,ISO)
post-traumatic stress disorder  (ISO)
Postoperative Cognitive Dysfunction  (ISO)
Prenatal Exposure Delayed Effects  (ISO)
Presbycusis  (ISO)
primary open angle glaucoma  (ISO)
psychotic disorder  (ISO)
pulmonary fibrosis  (ISO)
pulmonary sarcoidosis  (ISO)
Radiation Injuries  (ISO)
Referred Pain  (ISO)
Reperfusion Injury  (ISO)
Respiration Disorders  (IMP)
Respiratory Tract Infections  (ISO)
Retina Reperfusion Injury  (ISO)
retinal degeneration  (IDA,IMP,ISO)
rhinitis  (ISO)
schizophrenia  (ISO)
sciatic neuropathy  (ISO)
Seasonal Allergic Rhinitis  (ISO)
sensorineural hearing loss  (IEP)
Sjogren's syndrome  (ISO)
Sleep Deprivation  (ISO)
Spinal Cord Injuries  (ISO)
Spinal Cord Reperfusion Injury  (ISO)
status epilepticus  (ISO)
Stomach Neoplasms  (ISO)
stress-related disorder  (ISO)
systemic scleroderma  (ISO)
Tinnitus  (ISO)
Tobacco Use Disorder  (ISO)
type 2 diabetes mellitus  (ISO)
urticaria  (ISO)
vascular dementia  (ISO)
Visceral Pain  (IMP)
withdrawal disorder  (IEP,ISO)

Gene-Chemical Interaction Annotations     Click to see Annotation Detail View
(+)-catechin  (ISO)
(+)-epicatechin-3-O-gallate  (ISO)
(+)-pilocarpine  (EXP,ISO)
(+)-syringaresinol beta-D-glucoside  (EXP)
(-)-epigallocatechin 3-gallate  (ISO)
(20S)-ginsenoside Rg3  (EXP,ISO)
(R)-salsolinol  (ISO)
(R,R,R)-alpha-tocopherol  (EXP)
(S)-3,5-dihydroxyphenylglycine  (EXP)
(S)-AMPA  (ISO)
(S)-amphetamine  (EXP,ISO)
(S)-colchicine  (ISO)
(S)-naringenin  (ISO)
(S)-nicotine  (EXP,ISO)
1,1-dichloroethene  (EXP)
1,2-dimethylhydrazine  (ISO)
1-bromopropane  (EXP,ISO)
1-chloro-2,4-dinitrobenzene  (ISO)
1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine  (EXP)
13,14-dihydro-Delta(12)-prostaglandin J2  (ISO)
17alpha-ethynylestradiol  (ISO)
17beta-estradiol  (ISO)
17beta-estradiol 3-benzoate  (ISO)
2,2',4,4'-Tetrabromodiphenyl ether  (ISO)
2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine  (EXP,ISO)
2,3,7,8-Tetrachlorodibenzofuran  (ISO)
2,4-dibromophenyl 2,4,5-tribromophenyl ether  (ISO)
2,5-hexanedione  (ISO)
2-(4-iodo-2,5-dimethoxyphenyl)-1-methylethylamine  (EXP)
2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose  (EXP)
2-Hydroxy-6-(8,11,14-pentadecatrienyl)benzoic acid  (EXP)
2-methyl-6-(phenylethynyl)pyridine  (ISO)
2-palmitoylglycerol  (ISO)
3',5'-cyclic AMP  (ISO)
3,3',5,5'-tetrabromobisphenol A  (EXP,ISO)
3,4-dihydroxybenzoic acid  (EXP,ISO)
3,4-methylenedioxymethamphetamine  (EXP,ISO)
3-isobutyl-1-methyl-7H-xanthine  (ISO)
3-Methoxynobiletin  (ISO)
3-nitropropanoic acid  (ISO)
3H-1,2-dithiole-3-thione  (ISO)
4,4'-sulfonyldiphenol  (EXP,ISO)
4,5,6,7-TETRABROMOBENZOTRIAZOLE  (EXP)
4-[1-hydroxy-2-[4-(phenylmethyl)-1-piperidinyl]propyl]phenol  (ISO)
4-hydroxynon-2-enal  (ISO)
5-aza-2'-deoxycytidine  (ISO)
5-azacytidine  (EXP)
5-fluorouracil  (ISO)
5-methoxypsoralen  (EXP)
6-anilino-5,8-quinolinedione  (ISO)
6-Cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione  (ISO)
6-propyl-2-thiouracil  (ISO)
7,12-dimethyltetraphene  (EXP)
[6]-Shogaol  (EXP)
acetylsalicylic acid  (EXP)
acrolein  (ISO)
acrylamide  (ISO)
actinomycin D  (ISO)
aflatoxin B1  (ISO)
agathisflavone  (ISO)
agmatine  (EXP)
agomelatine  (EXP,ISO)
alcohol  (EXP)
aldehydo-D-glucosamine  (EXP)
all-trans-retinoic acid  (EXP,ISO)
alpha-D-galactose  (EXP)
alpha-pinene  (ISO)
alpha-Solamarine  (EXP)
AM-251  (EXP)
amantadine  (ISO)
amiodarone  (ISO)
ammonium chloride  (ISO)
amphetamine  (EXP)
anthra[1,9-cd]pyrazol-6(2H)-one  (ISO)
apigenin  (ISO)
arachidonic acid  (ISO)
aristolochic acid A  (ISO)
Aroclor 1254  (EXP,ISO)
arsane  (EXP,ISO)
arsanilic acid  (ISO)
arsenic atom  (EXP,ISO)
arsenite(3-)  (ISO)
arsenous acid  (EXP,ISO)
Asiaticoside  (ISO)
Atractylone  (ISO)
atrazine  (ISO)
Bardoxolone methyl  (EXP)
Bay-K-8644  (ISO)
benzo[a]pyrene  (EXP,ISO)
benzo[a]pyrene diol epoxide I  (ISO)
beta-D-glucosamine  (EXP)
bis(2-chloroethyl) sulfide  (EXP)
bis(2-ethylhexyl) phthalate  (EXP,ISO)
bisphenol A  (EXP,ISO)
bisphenol F  (EXP,ISO)
bromocriptine  (EXP)
bucladesine  (ISO)
bupivacaine  (ISO)
buprenorphine  (ISO)
Butylparaben  (ISO)
C60 fullerene  (ISO)
cabergoline  (ISO)
cadmium atom  (EXP,ISO)
cadmium dichloride  (EXP,ISO)
caffeine  (ISO)
calcitriol  (ISO)
calcium atom  (EXP,ISO)
calcium(0)  (EXP,ISO)
cannabidiol  (ISO)
capsaicin  (ISO)
carbamazepine  (ISO)
carbaryl  (ISO)
carbon dioxide  (ISO)
carbon monoxide  (ISO)
carbon nanotube  (EXP)
celastrol  (EXP)
CGP 52608  (ISO)
CGS-21680  (ISO)
chaetocin  (ISO)
chlorohydrocarbon  (ISO)
chloroprene  (EXP)
chlorpromazine  (ISO)
chlorpyrifos  (ISO)
cholesterol  (ISO)
choline  (EXP)
chondroitin sulfate  (ISO)
chrysin  (EXP)
cisplatin  (ISO)
Citreoviridin  (EXP)
clofibrate  (EXP)
clopidogrel  (ISO)
clozapine  (ISO)
cocaine  (EXP,ISO)
colforsin daropate hydrochloride  (EXP,ISO)
copper atom  (EXP,ISO)
copper(0)  (EXP,ISO)
copper(II) sulfate  (ISO)
corticosterone  (EXP,ISO)
creatine  (EXP)
crocidolite asbestos  (ISO)
crocin-1  (ISO)
Cuprizon  (ISO)
curcumin  (EXP,ISO)
cyanocob(III)alamin  (ISO)
cyclophosphamide  (ISO)
cyclosporin A  (ISO)
cyfluthrin  (ISO)
cypermethrin  (EXP,ISO)
daidzein 7-O-beta-D-glucoside  (EXP)
dantrolene  (EXP)
DDE  (ISO)
DDT  (EXP)
decabromodiphenyl ether  (EXP,ISO)
deguelin  (EXP,ISO)
dermatan sulfate  (ISO)
desferrioxamine B  (ISO)
desipramine  (EXP)
dexamethasone  (ISO)
diallyl disulfide  (EXP)
diarsenic trioxide  (EXP,ISO)
diazepam  (EXP,ISO)
diazinon  (EXP)
dibutyl phthalate  (EXP,ISO)
dichloroacetic acid  (EXP)
diethylstilbestrol  (EXP,ISO)
dihydroactinidiolide  (EXP)
diisopropyl fluorophosphate  (ISO)
dimethyl fumarate  (ISO)
dioxygen  (EXP,ISO)
disulfiram  (ISO)
dizocilpine maleate  (ISO)
donepezil hydrochloride  (EXP)
dopamine  (EXP)
dorsomorphin  (ISO)
doxorubicin  (ISO)
echinacoside  (ISO)
elemental selenium  (ISO)
endosulfan  (ISO)
enzacamene  (ISO)
epoxiconazole  (ISO)
ethanol  (EXP,ISO)
ethyl methanesulfonate  (ISO)
etoposide  (ISO)
eugenol  (EXP)
excitatory amino acid agonist  (ISO)
fenvalerate  (EXP,ISO)
fingolimod hydrochloride  (EXP)
fisetin  (ISO)
fluoranthene  (EXP)
fluoxetine  (EXP,ISO)
folic acid  (EXP)
formaldehyde  (EXP,ISO)
fulvestrant  (ISO)
Fusaric acid  (ISO)
galactose  (EXP)
galangin  (ISO)
gallic acid  (ISO)
gallocatechin  (ISO)
gamma-aminobutyric acid  (ISO)
gamma-hexachlorocyclohexane  (ISO)
gemcitabine  (ISO)
genistein  (EXP)
gentamycin  (ISO)
geraniol  (EXP)
gingerol  (EXP)
glycidol  (ISO)
glycyrrhizinic acid  (ISO)
glyphosate  (EXP)
haloperidol  (EXP,ISO)
herbicide  (ISO)
heroin  (ISO)
hydrogen peroxide  (EXP,ISO)
ifosfamide  (ISO)
imipramine  (EXP,ISO)
inulin  (EXP)
kainic acid  (ISO)
ketamine  (EXP,ISO)
ketanserin  (ISO)
KT 5823  (EXP,ISO)
L-ascorbic acid  (EXP,ISO)
L-methionine  (EXP)
lamotrigine  (ISO)
lead diacetate  (EXP,ISO)
lead(0)  (EXP,ISO)
linuron  (ISO)
lipopolysaccharide  (EXP,ISO)
lithium atom  (ISO)
lithium chloride  (ISO)
lithium hydride  (ISO)
lovastatin  (ISO)
LY294002  (EXP,ISO)
lycopene  (EXP,ISO)
malathion  (ISO)
maneb  (EXP,ISO)
manganese atom  (EXP,ISO)
manganese(0)  (EXP,ISO)
manganese(II) chloride  (EXP,ISO)
melatonin  (EXP,ISO)
melittin  (EXP)
mercury atom  (ISO)
mercury dibromide  (ISO)
mercury dichloride  (EXP)
mercury(0)  (ISO)
metformin  (ISO)
methamphetamine  (EXP,ISO)
methyl beta-cyclodextrin  (EXP)
methyl methanesulfonate  (ISO)
methylglyoxal  (ISO)
methyllycaconitine  (ISO)
methylmercury chloride  (EXP,ISO)
methylphenidate  (EXP,ISO)
mevastatin  (EXP)
mifepristone  (ISO)
mono(2-ethylhexyl) phthalate  (EXP)
monocrotaline  (ISO)
morin  (ISO)
morphine  (EXP,ISO)
muscimol  (ISO)
N-acetyl-L-cysteine  (EXP,ISO)
N-ethyl-N-nitrosourea  (ISO)
N-methyl-4-phenylpyridinium  (ISO)
N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine  (ISO)
N-methyl-N-nitrosourea  (ISO)
naproxen  (ISO)
nicardipine  (ISO)
nickel atom  (ISO)
nicotine  (EXP,ISO)
nicotinic acid  (ISO)
nifedipine  (ISO)
nimodipine  (EXP)
nitric oxide  (ISO)
Nonylphenol  (EXP,ISO)
ochratoxin A  (ISO)
olanzapine  (ISO)
oleuropein  (EXP)
ouabain  (ISO)
Oxadiazon  (ISO)
oxaliplatin  (ISO)
oxidopamine  (EXP)
ozone  (EXP,ISO)
paclitaxel  (ISO)
paliperidone palmitate  (ISO)
panaxydol  (ISO)
papaverine  (ISO)
paracetamol  (EXP,ISO)
paraldehyde  (ISO)
paraquat  (EXP,ISO)
parathion-methyl  (ISO)
paroxetine  (EXP)
pentetrazol  (EXP,ISO)
pentobarbital  (ISO)
perchlorate  (ISO)
perfluorohexanesulfonic acid  (ISO)
perfluorononanoic acid  (ISO)
perfluorooctane-1-sulfonic acid  (EXP,ISO)
permethrin  (EXP,ISO)
peroxynitrous acid  (ISO)
phenobarbital  (EXP)
phenylephrine  (ISO)
phosphorothioic O,O,S-acid  (ISO)
picrotoxin  (EXP,ISO)
pioglitazone  (EXP)
poly(I:C)  (EXP,ISO)
potassium atom  (EXP,ISO)
potassium chloride  (EXP)
potassium chromate  (ISO)
prasugrel hydrochloride  (ISO)
prochloraz  (ISO)
procymidone  (ISO)
prodigiosin  (ISO)
progesterone  (EXP,ISO)
propanal  (ISO)
pyrethrins  (EXP)
Pyridostigmine bromide  (EXP)
pyrrolidine dithiocarbamate  (ISO)
quartz  (EXP)
quercetin  (EXP)
quetiapine fumarate  (ISO)
quinolinic acid  (ISO)
reserpine  (EXP,ISO)
resveratrol  (EXP,ISO)
rimonabant  (EXP)
risperidone  (ISO)
ritanserin  (ISO)
rivastigmine  (ISO)
roflumilast  (ISO)
rolipram  (ISO)
romidepsin  (ISO)
rotenone  (EXP,ISO)
royal jelly  (ISO)
S-(1,2-dichlorovinyl)-L-cysteine  (ISO)
salvianolic acid B  (EXP)
saxagliptin  (ISO)
SB 431542  (ISO)
scopolamine  (EXP,ISO)
selenium atom  (ISO)
serotonin  (EXP,ISO)
sertraline  (EXP)
sevoflurane  (EXP,ISO)
silver atom  (ISO)
silver(0)  (ISO)
simvastatin  (ISO)
sirolimus  (EXP)
SKF-96365 hydrochloride  (EXP)
SL-327  (EXP)
sodium arsenate  (EXP)
sodium arsenite  (EXP,ISO)
sodium fluoride  (ISO)
Soman  (ISO)
sterigmatocystin  (ISO)
streptozocin  (EXP,ISO)
sulforaphane  (ISO)
sumatriptan  (ISO)
tacrine  (EXP)
tacrolimus hydrate  (ISO)
tadalafil  (EXP)
tamibarotene  (ISO)
tamoxifen  (ISO)
taurine  (ISO)
telmisartan  (EXP)
tert-butyl hydroperoxide  (ISO)
Testosterone propionate  (ISO)
tetrodotoxin  (EXP,ISO)
thioacetamide  (EXP)
titanium dioxide  (EXP,ISO)
toluene  (EXP)
topiramate  (ISO)
torcetrapib  (ISO)
tranylcypromine  (ISO)
triacsin C  (ISO)
triazolam  (EXP)
triazophos  (ISO)
trichloroethene  (EXP)
trichostatin A  (EXP,ISO)
undecane  (ISO)
valproic acid  (EXP,ISO)
venlafaxine hydrochloride  (ISO)
veratridine  (EXP,ISO)
vinclozolin  (ISO)
vorinostat  (EXP)
VX nerve agent  (EXP)
wortmannin  (EXP,ISO)
xenon atom  (ISO)
xenon(0)  (ISO)
zearalenone  (ISO)
zinc atom  (EXP)
zinc dichloride  (ISO)
zinc sulfate  (ISO)
zinc(0)  (EXP)
zolpidem  (EXP)