Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
Advanced Search (OLGA)

Ontology Browser
Term:
Parent Terms Term With Siblings Child Terms
cation +     
organic ion +     
butoconazole(1+) +  
inorganic cation +   
monoatomic cation +   
organic anion +   
organic cation +   
Any organic ion with a net positive charge.
organic radical ion +  
polyatomic cation +   
radical cation +  
salt +   
 (1R,3S)-3-(adamantan-1-yl)-1-(ammoniomethyl)-3,4-dihydroisochromene-5,6-diol(1+) +   
 (1S,2R)-5-methoxy-1-methyl-2-(propylammonio)tetralin(1+) +  
 (1S,2S,3R,5S)-3,5-diammoniocyclohexane-1,2-diol 
 (2R,3S)-EHNA(1+) +  
 (3R)-7,2'-dihydroxy-4'-methoxyisoflavanol 4-oxonium cation 
 (4aR,10bS)-noroxomaritidine(1+) 
 (4aS,10bR)-noroxomaritidine(1+) 
 (4aS,10bR)-oxomaritidine(1+) 
 (5,6-dimethyl-1,10-phenanthroline)(1S,2S-diaminocyclohexane)platinum(II)(2+) 
 (R)-2-methylpyrrolidinium 
 (R)-adrenaline(1+) 
 (R)-eberconazole(1+) +  
 (R)-fenticonazole(1+) +  
 (R)-fluoxetine(1+) +   
 (R)-isoconazole(1+) +  
 (R)-laudanosine(1+) 
 (R)-nefopam(1+) +  
 (R)-nicotinium(1+) 
 (R)-noradrenaline(1+) 
 (R)-orciprenaline(1+) +  
 (R)-oxpoconazole(1+) +  
 (R)-prasugrel(1+) +   
 (R)-reticulinium(1+) 
 (R)-SKF 38393(1+) +  
 (R)-tetrahydropapaverine(1+) 
 (R)-tetrindole(1+) +  
 (R,R)-asenapine(1+) +  
 (R,R)-tramadol(1+) +  
 (R,S,S,S)-nebivolol(1+) +  
 (S)-3'-hydroxy-N-methylcoclaurinium(1+) 
 (S)-6-hydroxynicotinium(1+) 
 (S)-atropinium 
 (S)-codamine(1+) 
 (S)-eberconazole(1+) +  
 (S)-fenticonazole(1+) +  
 (S)-fluoxetine(1+) +   
 (S)-glaucine(1+) 
 (S)-isoconazole(1+) +  
 (S)-laudanosine(1+) 
 (S)-N-methylcoclaurinium(1+) 
 (S)-nefopam(1+) +  
 (S)-norcoclaurinium(1+) 
 (S)-orciprenaline(1+) +  
 (S)-oxpoconazole(1+) +  
 (S)-prasugrel(1+) +   
 (S)-sertaconazole(1+) +  
 (S)-SKF 38393(1+) +  
 (S)-tetrahydropapaverine(1+) 
 (S)-tetrindole(1+) +  
 (S,R,R,R)-nebivolol(1+) +  
 (S,S)-asenapine(1+) +  
 (S,S)-formoterol(1+) +   
 (S,S)-tramadol(1+) +  
 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-1'-(3'-O-L-arginyl)-sn-glycerol(1+) 
 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-1'-(3'-O-L-lysyl)-sn-glycerol(1+) +  
 1,2-dimethylhydrazine(2+) +  
 1,3-thiazolium cation +   
 1-(2-oxo-2-phenylethyl)tetrahydrothiophenium +  
 1-(3-aminopropyl)pyrrolinium 
 1-(5-isoquinolinesulfonyl)-2-methylpiperazine(2+) +  
 1-[(3S,4R,5R,6R)-6-carboxy-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]-3-(4-acetamidobenzenesulfonamido)-2-phenyl-1lambda5-pyrazol-1-ylium 
 1-[1-(1-benzothiophen-2-yl)cyclohexyl]piperidinium(1+) +  
 1-[2-(benzhydryloxy)ethyl]-4-(3-phenylpropyl)piperazinediium(2+) +  
 1-[6-carboxy-8-(2,4-difluorophenyl)-3-fluoro-5-oxo-5,8-dihydro-1,8-naphthyridin-2-yl]pyrrolidin-3-aminium +  
 1-butyl-2-[(2,6-dimethylphenyl)carbamoyl]piperidinium +  
 1-hexadecyl-2-ammonio-2-deoxy-sn-glycerol +  
 1-hydroxy-3-(indol-3-ylmethyl)-6H,7H,8H-5lambda(5)-pyrrolo[1,2-a]pyrazin-5-ylium 
 1-hydroxy-3-\{[2-(1,1-dimethylallyl)-indol-3-yl]methyl\}-4H,6H,7H,8H-pyrrolo[1,2-a]pyrazin-2-ium 
 1-hydroxy-3-\{[2-(1,1-dimethylallyl)-indol-3-yl]methyl\}-6H,7H,8H-5lambda(5)-pyrrolo[1,2-a]pyrazin-5-ylium 
 1-methylpyrrolinium 
 1-tuberculosinyladenosine(1+) 
 13-deoxydaunorubicin(1+) 
 13-dihydrodaunorubicin(1+) 
 15-methylhexadecasphing-4-enine-1-phosphocholine(1+) 
 17-dehydropreakuammicine hydrate(1+) 
 17-dehydropreakuammicine(1+) 
 17-hydroxylupanine(1+) 
 1D-3-ammmonio-1-guanidiniumyl-1,3-dideoxy-scyllo-inositol(2+) 
 2'''-acetyl-6'''-hydroxyneomycin C(4+) 
 2'-deamino-2'-hydroxy-6'-dehydroparomamine(2+) 
 2'-deamino-2'-hydroxyneamine(3+) 
 2'-deamino-2'-hydroxyparomamine(2+) 
 2'-hydroxyrifampicin(1-) 
 2'-N-acetylparomamine(2+) 
 2'-oxokanamycin(4+) 
 2,3,5-triphenyltetrazolium +  
 2,6,9-trimethyl-13-oxatetracyclo[6.3.1.1(6,9).0(1,5)]tridecane carbocation 
 2,6-diamino-2,3,6-trideoxy-alpha-D-glucose(2+) 
 2,6-dihydroxypseudooxynicotinium(1+) 
 2-\{[(2E)-3-iodoprop-2-en-1-yl](propyl)ammonio\}tetralin-7-ol(1+) +  
 2-arylethylammomium(1+) 
 2-chloro-1,4-phenylenediaminium +  
 2-deoxy-scyllo-inosamine(1+) 
 2-deoxystreptamine cation +  
 2-deoxystreptamine(1+) 
 2-deoxystreptamine(2+) 
 2-dimethylammonioethyl chloride +  
 2-methyl-beta-carbolinium-6-ol 
 3''-deamino-3''-hydroxykanamycin B(4+) 
 3''-deamino-3''-hydroxykanamycin C(3+) 
 3''-deamino-3''-hydroxykanamycin X(2+) 
 3'-N-debenzoyl-2'-deoxytaxol(1+) 
 3'-N-debenzoyltaxol(1+) 
 3,3'-neotrehalosadiamine(2+) 
 3,7-bis(dimethylamino)-4-nitrophenothiazin-5-ium +  
 3,7-bis(dimethylamino)phenothiazin-5-ium +   
 3,7-diamino-2,8-dimethyl-5-phenylphenazin-5-ium +  
 3,7-diamino-5-phenylphenazin-5-ium +  
 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium +   
 3-(4-aminobenzenesulfonamido)-1-[(3S,4R,5R,6R)-6-carboxy-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]-2-phenyl-1lambda5-pyrazol-1-ylium 
 3-(dimethylamino)-7-(methylamino)phenothiazin-5-ium +   
 3-(methylaminomethyl)indole(1+) 
 3-amino-3-deoxy-D-glucopyranose(1+) 
 3-amino-7-(dimethylamino)phenothiazin-5-ium +   
 3-amino-7-(methylamino)phenothiazin-5-ium +  
 3-ammonio-2,3-dideoxy-scyllo-inosose(1+) 
 3-ammoniopropanal 
 3-hydroxyquininium 
 3-oxohexobarbital 
 3-phenyl-5-thioxo-2,5-dihydro-1,2,3-oxadiazol-3-ium 
 4'-O-methylnorbelladine(1+) 
 4-(3-chlorophenyl)-1-(2-hydroxy-3,3-diphenylpropyl)piperazin-1-ium(1+) +  
 4-[(21-amino-4,9,12-trioxo-16,19-dioxa-5,8,13-triazahenicos-1-yl)oxy]malachite green cation 
 4-ammoniobutanal 
 4-fluoro-N-\{2-[4-(7-methoxynaphthalen-1-yl)piperazin-1-yl]ethyl\}benzamide(1+) +   
 4-hydroxytryptamine(1+) 
 4-methoxy-3-indolylmethylamine(1+) 
 4-O-methylrhodomycin D(1+) 
 5''-phosphoribostamycin(2+) 
 5-amino-5-(4-hydroxybenzyl)-6-(D-ribitylimino)-5,6-dihydrouracil(1+) 
 5-aminomethyl-2-thiouridine(1+) +  
 5-ammoniopentanal 
 5-ammoniopentanamide 
 5-methyl[1,2,4]triazolo[3,4-b][1,3]benzothiazol-1-ium 
 5-nonyloxytryptaminium(1+) +  
 5-O-beta-D-mycaminosyl-20-oxotylonolide(1+) 
 5-O-beta-D-mycaminosyltylactone(1+) 
 5-O-mycaminosyltylonolide(1+) 
 6'''-hydroxyneomycin C(5+) 
 6'''-oxoneomycin C(5+) 
 6''-O-carbamoylkanamycin A(4+) 
 6,7-Dihydro-4-(hydroxymethyl)-2-(p-hydroxyphenethyl)-7-methyl-5H-2-pyrindinium 
 6,8-dimethyl-6,7-didehydroergolin-6-ium 
 6-bromoharminium(1+) +  
 6-hydroxy-N-methylmyosmine(1+) 
 6-O-methyl-N-deacetylipecoside aglycone(1+) 
 6-O-methyldeacetylisoipecoside aglycone(1+) 
 7,2'-dihydroxy-4'-methoxyisoflavan-4-ylium cation 
 7-methylguanosine +  
 7-methylinosine 
 8-benzyloxy-5,7-diphenylquinoline(1+) 
 acarbose(1+) 
 acridinium ion +   
 adenosine 5'-monophosphate(1+) 
 aldehydo-D-kanosamine(1+) 
 alectinib(1+) +  
 alkane-alpha,omega-diammonium(2+) +  
 alogliptin(1+) +  
 alpha-D-kanosamine(1+) 
 alstonine(1+) 
 ambiguine H(1+) 
 amikacin(4+) +  
 amiloride(1+) +  
 amino-acid cation +   
 aminopropylcadaverine(3+) 
 ammonioacetaldehyde 
 ammonioacetone 
 amodiaquine(1+) 
 ancitabine(1+) +  
 anthocyanidin cation +   
 anthocyanin +   
 anthracycline cation +  
 arasertaconazole(1+) +  
 arformoterol(1+) +   
 argemonine(1+) 
 ATTO 565 para-isomer(1+) +  
 ATTO 590 meta-isomer(1+) +  
 ATTO 590 para-isomer(1+) +  
 ATTO 610-2(1+) +  
 ATTO 635-2(1+) +  
 bedaquiline(2+) +  
 benzothiazolium ion +   
 benzoxazolium ion +  
 benzydamine(1+) 
 bepotastine(1+) +  
 BGT226(1+) +  
 BoBo-1(4+) +  
 BoBo-3(4+) +  
 brilliant cresyl blue(1+) +  
 bulbocapnine(1+) 
 butirosin B(4+) 
 caldopentamine(4+) 
 caldopentamine(5+) 
 carbocyanin DBTC(1+) +  
 carbon monoxide(1+) 
 cariprazine(1+) +  
 carmoxirole(1+) +  
 cationic sphingoid +  
 Celestin blue B(1+) +  
 CGP 78608(1+) +  
 chanoclavine-I(1+) 
 chelerythrine  
 chelirubine +  
 chloroeremomycin(2+) 
 chloroorienticin B(1+) 
 chromenyliums +   
 clidinium +   
 clobenpropit(2+) +  
 clomipramine(1+) +  
 cobimetinib(1+) +  
 coformycin(1+) 
 cresyl violet +  
 Cu(I)-S-Mo(IV)(=O)O-NBIC Cluster 
 cyclohexyl isocyanide(1+) 
 cyclopentadienylium 
 cysteaminium 
 D-cycloserine(1+) 
 D-synephrine(1+) 
 dabigatran etexilate(1+) +  
 daclatasvir(2+) +  
 deacetylipecoside aglycone(1+) +  
 deacetylipecoside(1+) +  
 demethyllactenocin(1+) +  
 demethylmacrocin(1+) 
 DH334(1+) +  
 DH335(1+) +  
 diazonium ion +  
 dibenziodolium +   
 didehydroagroclavine 
 dihydrochanoclavine-I aldehyde(1+) 
 dihydroprecondylocarpine acetate 
 dihydroprecondylocarpine acetate (enamine form) 
 dihydrostreptomycin 6-phosphate(1+) 
 dimethylaminium +  
 diquat  
 E-3810(1+) +  
 ecgononium methyl ester(1+) 
 edoxaban(1+) +  
 eliglustat(1+) +  
 epivancomycin(1+) 
 epoxyqueuine(1+) 
 eprazinone(2+) +  
 eribulin(1+) +  
 erythromycin cation +  
 ethyl nile blue(1+) +  
 ethylaminium +  
 festuclavine(1+) 
 fingolimod(1+) +   
 flecainide(1+) +  
 FR901469(1+) +  
 framycetin(6+) 
 fumigaclavine A(1+) 
 fumigaclavine B(1+) 
 fumigaclavine C(1+) 
 Gallamin blue(1+) +  
 gallocyanin(1+) +  
 gentamicin C(5+) 
 gentamycin(2+) +  
 gevotroline(1+) +  
 GGTI-2133 free base(1+) +   
 GR 127935(1+) +  
 gramine(1+) 
 Hoffman's violet(1+) 
 homoserinium lactone 
 imetit(2+) +  
 imidazolium ion +   
 iminium ion +   
 indacaterol(1+) +  
 indole alkaloid cation +  
 indolium ion +  
 indolmycin(1+) 
 intermediate I 
 iodonitrotetrazolium +  
 irinotecan(1+) +  
 isavuconazonium +  
 isochromenylium 
 ivabradine(1+) +  
 JTE-607(2+) +  
 kanamycin A(4+) +  
 kanamycin B(5+) 
 kanamycin C(4+) 
 kanamycin D(3+) 
 kanamycin X(3+) 
 L-adenosylselenomethionine 
 L-adenosylselenomethionine zwitterion 
 L-alaninamide(1+) 
 L-arginyl-AMP(1+) 
 L-histidinal(1+) 
 laudanine(1+) +  
 legionaminate(1+) 
 levobunolol(1+) +  
 lomitapide(1+) +  
 loperamide(1+) +  
 lorcaserin(1+) +  
 lupanine(1+) 
 lurasidone(1+) +   
 macarpine 
 macrocin(1+) 
 mauveine A +  
 mauveine B +  
 mauveine B2 +  
 mauveine C +  
 melamine(1+) 
 memantinium(1+) +  
 meso-tetrakis(N-methyl-4-pyridyl)porphine(4+) +   
 methiothepin(2+) +  
 methoctramine(4+) +   
 methyl-Co(2+) 
 methylated primary amine(1+) +  
 methylium +  
 methymycin(1+) 
 metronidazole(1+) +  
 morphine(1+) 
 moxifloxacinium(1+) +  
 mycinamicin cation +  
 N(1),N(8)-bis(coumaroyl)spermidine(1+) 
 N(1)-acetylspermidinium(2+) 
 N(1)-acetylsperminium(3+) 
 N(2),N(2),N(7)-trimethylguanosine 5'-triphosphate(1+) +  
 N(3')-acetylgentamycin C(4+) 
 N(4)-aminopropylspermidine(4+) +  
 N(4)-aminopropylspermine(5+) 
 N(4)-bis(aminopropyl)spermidine(5+) 
 N(6')-acetylkanamycin B(4+) 
 N(alpha)-acetyl-L-lysine methyl ester(1+) 
 N(gamma)-nitro-L-arginine methyl ester(1+) +  
 N-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-2-ylmethyl)-2-(2,6-dimethoxyphenoxy)ethanaminium(1+) +  
 N-(4-aminobutyl)-5-chloronaphthalene-2-sulfonamide(1+) +  
 N-[1,4-dioxo-3-(1-pyridin-1-iumyl)-2-naphthalenyl]-2-thiophenesulfonamide 
 N-[2-(4-bromocinnamylamino)ethyl]isoquinoline-5-sulfonamide(2+) +  
 N-acetylputrescinium 
 N-allyl-1-phenyl-2,3,4,5-tetrahydro-3-benzazepinium-7,8-diol(1+) +  
 N-allyl-6-chloro-1-(3-methylphenyl)-2,3,4,5-tetrahydro-3-benzazepinium-7,8-diol(1+) +  
 N-carbamoylputrescinium(1+) 
 N-deacetylisoipecoside aglycone(1+) 
 N-demethylindolmycin(1+) 
 N-methyl-6-chloro-1-(3-methylphenyl)-2,3,4,5-tetrahydro-3-benzazepinium-7,8-diol(1+) +  
 N-methylputrescinium(2+) 
 N-methyltyraminium 
 N-monoacetylalkane-alpha,omega-diamine(1+) 
 naltrexone(1+) +  
 NAN 190(1+) +   
 narbomycin(1+) 
 neamine(4+) +  
 nebramycin 5'(5+) 
 nelfinavir(1+) +  
 neomethymycin(1+) 
 neomycin C(6+) 
 neopikromycin(1+) 
 neutral red(1+) +  
 nile blue(1+) +  
 nimustine(1+) +  
 nintedanib(1+) +  
 nitridocarbon(1+) 
 nitro blue tetrazolium(2+) +   
 noradrenaline(1+) +  
 norajmaline(1+) 
 norbelladine(1+) 
 nororientalinium(1+) 
 nostocarboline 
 novamethymycin(1+) 
 novapikromycin(1+) 
 O-demethylpuromycin(1+) 
 octopaminium +  
 olodaterol(1+) +  
 organic radical cation +  
 oripavine(1+) 
 osimertinib(1+) +  
 oxazine-1 +  
 oxazine-170(1+) +  
 oxazine-750 
 oxycodone(1+) +  
 palonosetron(1+) +  
 panobinostat(1+) +  
 paraquat +   
 paroxetinium(1+) +  
 pavine(1+) 
 pazopanib(1+) +  
 PD-153035(1+) +  
 pentolinium ion +   
 pentostatin(1+) 
 peptide cation +  
 phenazopyridine(1+) +  
 phenoxenium 
 phentermine(1+) 
 phenylephrine(1+) +  
 pikromycin(1+) 
 pipacycline(1+) +  
 piperidinium ion +   
 polycationic macromolecule +  
 precondylocarpine acetate 
 primary alkymercury(1+) +  
 primary ammonium ion +  
 prinomastat(1+) +  
 procaine(1+) +  
 procarbazine(1+) +  
 pseudoephedrine(1+) +  
 pseudooxynicotinium(1+) +  
 puromycin(1+) +  
 pyocyanine(1+) 
 pyridazinium ion +  
 pyridinium ion +   
 pyridoxaminium(1+) +  
 pyryliums +  
 quaternary ammonium ion +   
 queuine(1+) 
 quinine(1+) +   
 quininib(1+) +  
 quinolinium ion +   
 retaspimycin(1+) +  
 reticuline(1+) +  
 reticulinylium 
 rhodamine 110(1+) +  
 rhodamine 123(1+) +   
 rhodamine 6G(1+) +   
 rhodamine 700 +  
 rhodamine B(1+) +  
 rhodomycin D(1+) 
 ribostamycin(4+) +  
 rilpivirine(1+) +  
 ritlecitinib(1+) +  
 rivastigmine(1+) +  
 Ro 48-8071(1+) +  
 rolapitant(1+) +  
 RS 39604(1+) +  
 rucaparib(1+) +  
 S-acetylcysteaminium 
 S-adenosyl-4-methylthio-2-oxobutanoic acid 
 S-adenosyl-L-methionine zwitterion +  
 S-adenosyl-S-carboxymethyl-L-homocysteine 
 salutaridinium(1+) 
 SB 224289(1+) +  
 secondary ammonium ion +   
 senecionine(1+) 
 sepantronium +   
 serpentine(1+) 
 sertraline(1+) +  
 SKF-96365 free base(1+) +   
 spectinomycin(2+) +  
 spermidine(3+) +  
 spirit blue(1+) +  
 stepharanine 
 streptomycin 3''-phosphate(1+) 
 streptomycin 6-phosphate(1+) 
 strictosidine aglycone(1+) 
 sulfocholine +  
 sumatriptan(1+) +  
 tenofovir alafenamide(1+) +  
 terbinafine(1+) +  
 tertiary ammonium ion +   
 tetradecaphytosphingosine(1+) 
 tetramethylchloromethylrosamine +  
 tetramethylrhodamine ethyl ester(1+) +  
 tetramethylrhodamine thiocyanate cation +  
 tetrazolium blue(2+) +  
 tetrazolium violet(1+) +   
 thiocyclam(1+) +  
 thionine cation +  
 tobramycin(5+) +  
 tolonium +   
 tricaine(1+) +  
 triethanolammonium +  
 trimethylselenonium 
 triphenylsulfonium +  
 triplatin(4+) +  
 tritylium 
 tropisetron(1+) +  
 trovafloxacin(1+) +  
 trypanothione(1+) 
 tylosin(1+) 
 validoxylamine A(1+) 
 vancomycin(1+) 
 vanoxerine(2+) +   
 varenicline(1+) +  
 vilanterol(1+) +  
 vilazodone(1+) +  
 vortioxetine(1+) +  
 xylazine(1+) +  
 ZM 323881 
 ZM 323881(1+) +  

Synonyms
Related Synonyms: organic cations

paths to the root