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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:proteinogenic amino acid
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Accession:CHEBI:83813 term browser browse the term
Definition:Any of the 23 alpha-amino acids that are precursors to proteins, and are incorporated into proteins during translation. The group includes the 20 amino acids encoded by the nuclear genes of eukaryotes together with selenocysteine, pyrrolysine, and N-formylmethionine. Apart from glycine, which is non-chiral, all have L configuration.
Synonyms:related_synonym: canonical amino acid;   canonical amino acids;   proteinogenic amino acids
 xref: Wikipedia:Proteinogenic_amino_acid



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      CHEBI ontology 19878
        role 19848
          application 19690
            NMR chemical shift reference compound 18062
              ammonia 17861
                organic amino compound 17861
                  amino acid 16049
                    proteinogenic amino acid 12950
                      L-alanine + 106
                      L-arginine + 109
                      L-asparagine + 78
                      L-aspartic acid + 183
                      L-cysteine + 3416
                      L-glutamic acid + 10256
                      L-glutamine + 21
                      L-histidine + 14
                      L-isoleucine + 3
                      L-leucine + 176
                      L-lysine + 56
                      L-methionine + 3532
                      L-phenylalanine + 2397
                      L-proline + 299
                      L-pyrrolysine 0
                      L-selenocysteine + 82
                      L-serine + 57
                      L-threonine + 2
                      L-tryptophan + 21
                      L-tyrosine + 17
                      L-valine + 117
                      N-formyl-L-methionine + 61
                      aspartate family amino acid + 3690
                      erythrose 4-phosphate/phosphoenolpyruvate family amino acid + 2402
                      glutamine family amino acid + 10317
                      glycine + 3324
                      proteinogenic amino acid derivative + 12497
                      pyruvate family amino acid + 331
                      serine family amino acid + 5744
    Path 2
    Term Annotations click to browse term
      CHEBI ontology 19878
        subatomic particle 19876
          composite particle 19876
            hadron 19876
              baryon 19876
                nucleon 19876
                  atomic nucleus 19876
                    atom 19876
                      main group element atom 19815
                        main group molecular entity 19815
                          s-block molecular entity 19650
                            hydrogen molecular entity 19631
                              hydrides 19137
                                inorganic hydride 18153
                                  pnictogen hydride 18143
                                    nitrogen hydride 18056
                                      azane 17862
                                        ammonia 17861
                                          organic amino compound 17861
                                            amino acid 16049
                                              proteinogenic amino acid 12950
                                                L-alanine + 106
                                                L-arginine + 109
                                                L-asparagine + 78
                                                L-aspartic acid + 183
                                                L-cysteine + 3416
                                                L-glutamic acid + 10256
                                                L-glutamine + 21
                                                L-histidine + 14
                                                L-isoleucine + 3
                                                L-leucine + 176
                                                L-lysine + 56
                                                L-methionine + 3532
                                                L-phenylalanine + 2397
                                                L-proline + 299
                                                L-pyrrolysine 0
                                                L-selenocysteine + 82
                                                L-serine + 57
                                                L-threonine + 2
                                                L-tryptophan + 21
                                                L-tyrosine + 17
                                                L-valine + 117
                                                N-formyl-L-methionine + 61
                                                aspartate family amino acid + 3690
                                                erythrose 4-phosphate/phosphoenolpyruvate family amino acid + 2402
                                                glutamine family amino acid + 10317
                                                glycine + 3324
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