Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:2,5-diketopiperazines
go back to main search page
Accession:CHEBI:65061 term browser browse the term
Definition:Any piperazinone that has a piperazine-2,5-dione skeleton.
Synonyms:related_synonym: 2,5-diazacyclohexane-1,4-diones;   2,5-dioxopiperazines;   Formula=C4H4N2O2R2;   SMILES=[*]C1NC(=O)C([*])NC1=O;   cyclodipeptide;   cyclodipeptides
 xref: Wikipedia:Diketopiperazine



show annotations for term's descendants           Sort by:
rhodotorulic acid term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mmp2 matrix metallopeptidase 2 multiple interactions
decreases activity
ISO Calcium Chloride inhibits the reaction [rhodotorulic acid results in decreased activity of MMP2 protein]; ferric chloride inhibits the reaction [rhodotorulic acid results in decreased activity of MMP2 protein] CTD PMID:10086886 NCBI chr19:14,154,657...14,182,870
Ensembl chr19:14,154,657...14,182,870
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19880
    chemical entity 19878
      group 19831
        organic group 18983
          amino-acid residue 11442
            peptide 11442
              cyclic peptide 8925
                homodetic cyclic peptide 8404
                  2,5-diketopiperazines 1
                    3-acetamino-6-isobutyl-2,5-dioxopiperazine 0
                    3-methylpiperazine-2,5-dione 0
                    7'-demethoxyrostratin C 0
                    7-dimethylallyl isoechinulin B anion 0
                    7-dimethylallyl neoechinulin B anion 0
                    A 21101-IL 0
                    A26771A 0
                    Acetylaranotin 0
                    Ambewelamide A 0
                    Ambewelamide B 0
                    Brocazine A 0
                    Brocazine B 0
                    Brocazine C 0
                    Brocazine D 0
                    Brocazine E 0
                    Brocazine F 0
                    Brocazine G 0
                    Emethallicin A 0
                    Epicoccin T 0
                    Epicoccin U 0
                    Epicorazine A 0
                    Epicorazine C 0
                    Graphiumin A 0
                    Phaeosphaone A 0
                    Phomazine C 0
                    SCH-64874 0
                    TAN-1496 A 0
                    TAN-1496-D 0
                    albonoursin 0
                    amoxicillin diketopiperazine 0
                    cyclo(DeltaAla-L-Val) 0
                    cyclo(L-arginyl-L-aspartyl) zwitterion 0
                    cyclo(L-arginyl-L-glutamyl) zwitterion 0
                    cyclo(L-arginyl-L-leucyl)(+1) 0
                    cyclo(L-arginyl-L-tryptophyl)(+1) 0
                    cyclo(L-arginyl-tyrosyl)(+1) + 0
                    cyclo(L-leucyl-L-leucyl) 0
                    cyclo(L-leucyl-L-methionyl) 0
                    cyclo(L-phenylalanyl-L-leucyl) 0
                    cyclo(L-phenylalanyl-L-phenylalanyl) 0
                    cyclo(L-tryptophyl-L-alanyl) + 0
                    cyclo(L-tryptophyl-L-tryptophyl) 0
                    cyclo(L-tyrosyl-L-phenylalanyl) 0
                    cyclo(dehydrophenylalanyl-L-leucyl) 0
                    cyclo(epoxy-N(8)-(alpha,alpha-dimethylallyl)-L-Trp-6a-(alpha,alpha-dimethylallyl)-L-Trp) 0
                    cyclo(tyrosyl-tyrosyl) + 0
                    dehydroechinulin 0
                    desferricoprogen 0
                    desferricoprogen B 0
                    echinulin 0
                    fellutanine 0
                    glioperazine B 0
                    halimide + 0
                    isoechinulin A 0
                    isoechinulin B 0
                    isoechinulin B anion 0
                    mycocyclosin 0
                    neoechinulin A 0
                    neoechinulin B (anion) 0
                    notoamide + 0
                    piperazine-2,5-dione 0
                    plinabulin 0
                    preechinulin 0
                    rhodotorulic acid 1
                    tardioxopiperazine A 0
                    tardioxopiperazine B 0
                    variecolorin G 0
                    variecolorin L 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19880
    subatomic particle 19878
      composite particle 19878
        hadron 19878
          baryon 19878
            nucleon 19878
              atomic nucleus 19878
                atom 19878
                  main group element atom 19817
                    p-block element atom 19817
                      carbon group element atom 19757
                        carbon atom 19754
                          organic molecular entity 19754
                            heteroorganic entity 19512
                              organochalcogen compound 19275
                                organooxygen compound 19191
                                  carbon oxoacid 18658
                                    carboxylic acid 18655
                                      carboacyl group 17699
                                        univalent carboacyl group 17699
                                          carbamoyl group 17550
                                            carboxamide 17550
                                              peptide 11442
                                                cyclic peptide 8925
                                                  homodetic cyclic peptide 8404
                                                    2,5-diketopiperazines 1
                                                      3-acetamino-6-isobutyl-2,5-dioxopiperazine 0
                                                      3-methylpiperazine-2,5-dione 0
                                                      7'-demethoxyrostratin C 0
                                                      7-dimethylallyl isoechinulin B anion 0
                                                      7-dimethylallyl neoechinulin B anion 0
                                                      A 21101-IL 0
                                                      A26771A 0
                                                      Acetylaranotin 0
                                                      Ambewelamide A 0
                                                      Ambewelamide B 0
                                                      Brocazine A 0
                                                      Brocazine B 0
                                                      Brocazine C 0
                                                      Brocazine D 0
                                                      Brocazine E 0
                                                      Brocazine F 0
                                                      Brocazine G 0
                                                      Emethallicin A 0
                                                      Epicoccin T 0
                                                      Epicoccin U 0
                                                      Epicorazine A 0
                                                      Epicorazine C 0
                                                      Graphiumin A 0
                                                      Phaeosphaone A 0
                                                      Phomazine C 0
                                                      SCH-64874 0
                                                      TAN-1496 A 0
                                                      TAN-1496-D 0
                                                      albonoursin 0
                                                      amoxicillin diketopiperazine 0
                                                      cyclo(DeltaAla-L-Val) 0
                                                      cyclo(L-arginyl-L-aspartyl) zwitterion 0
                                                      cyclo(L-arginyl-L-glutamyl) zwitterion 0
                                                      cyclo(L-arginyl-L-leucyl)(+1) 0
                                                      cyclo(L-arginyl-L-tryptophyl)(+1) 0
                                                      cyclo(L-arginyl-tyrosyl)(+1) + 0
                                                      cyclo(L-leucyl-L-leucyl) 0
                                                      cyclo(L-leucyl-L-methionyl) 0
                                                      cyclo(L-phenylalanyl-L-leucyl) 0
                                                      cyclo(L-phenylalanyl-L-phenylalanyl) 0
                                                      cyclo(L-tryptophyl-L-alanyl) + 0
                                                      cyclo(L-tryptophyl-L-tryptophyl) 0
                                                      cyclo(L-tyrosyl-L-phenylalanyl) 0
                                                      cyclo(dehydrophenylalanyl-L-leucyl) 0
                                                      cyclo(epoxy-N(8)-(alpha,alpha-dimethylallyl)-L-Trp-6a-(alpha,alpha-dimethylallyl)-L-Trp) 0
                                                      cyclo(tyrosyl-tyrosyl) + 0
                                                      dehydroechinulin 0
                                                      desferricoprogen 0
                                                      desferricoprogen B 0
                                                      echinulin 0
                                                      fellutanine 0
                                                      glioperazine B 0
                                                      halimide + 0
                                                      isoechinulin A 0
                                                      isoechinulin B 0
                                                      isoechinulin B anion 0
                                                      mycocyclosin 0
                                                      neoechinulin A 0
                                                      neoechinulin B (anion) 0
                                                      notoamide + 0
                                                      piperazine-2,5-dione 0
                                                      plinabulin 0
                                                      preechinulin 0
                                                      rhodotorulic acid 1
                                                      tardioxopiperazine A 0
                                                      tardioxopiperazine B 0
                                                      variecolorin G 0
                                                      variecolorin L 0
paths to the root