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CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.
Term:L-lysine derivative
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Accession:CHEBI:25095 term browser browse the term
Definition:A proteinogenic amino acid derivative resulting from reaction of L-lysine at the amino group or the carboxy group, or from the replacement of any hydrogen of L-lysine by a heteroatom.
Synonyms:related_synonym: L-lysine derivatives


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5-(beta-D-galactosyloxy)-L-lysine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G App amyloid beta precursor protein multiple interactions ISO [APP protein mutant form co-treated with PSEN1 protein mutant form] results in decreased abundance of galactosylhydroxylysine; PF-06840003 inhibits the reaction [[APP protein mutant form co-treated with PSEN1 protein mutant form] results in decreased abundance of galactosylhydroxylysine] CTD PMID:39172838 NCBI chr11:24,019,774...24,236,584
Ensembl chr11:24,019,778...24,236,561 		JBrowse link
G Psen1 presenilin 1 multiple interactions ISO [APP protein mutant form co-treated with PSEN1 protein mutant form] results in decreased abundance of galactosylhydroxylysine; PF-06840003 inhibits the reaction [[APP protein mutant form co-treated with PSEN1 protein mutant form] results in decreased abundance of galactosylhydroxylysine] CTD PMID:39172838 NCBI chr 6:103,323,052...103,375,088
Ensembl chr 6:103,323,120...103,371,650 		JBrowse link
L-homoarginine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Slco4c1 solute carrier organic anion transporter family, member 4C1 increases export ISO SLCO4C1 protein results in increased export of Homoarginine CTD PMID:30865704 NCBI chr 9:97,177,497...97,229,161
Ensembl chr 9:97,178,861...97,229,715 		JBrowse link
Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19880
    role 19850
      application 19695
        pharmaceutical 19532
          drug 19532
            nutraceutical 13372
              L-lysine 56
                L-lysine derivative 3
                  (3S)-3-hydroxy-L-lysine 0
                  (Z)-N(6)-[(4R,5S)-5-(2-carboxyethyl)-4-(carboxymethyl)piperidin-3-ylidene]-L-lysine 0
                  1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-1'-(3'-O-L-lysyl)-sn-glycerol 0
                  1-(L-norleucin-6-yl)pyrraline 0
                  4-chloro-L-lysine 0
                  5'-(N(6)-L-lysine)-L-tyrosylquinone + 0
                  5-[(alpha-D-glucopyranosyl-(1->2)-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-L-lysine + 0
                  5-glycosyloxy-L-lysine + 2
                  D-lysopine 0
                  L-2-aminohexano-6-lactam 0
                  L-796,778 0
                  L-homoarginine 1
                  L-homocitrulline + 0
                  L-lysinamide + 0
                  L-lysine 2-naphthylamide 0
                  L-lysine thiazolecarboxylic acid 0
                  L-lysyl ester + 0
                  L-lysyl levuloglandin E2 adduct 0
                  L-saccharopine 0
                  Lys-GalA 0
                  N(2)-(5'-phosphopyridoxyl)-L-lysine 0
                  N(2)-acetyl-N(6)-(1,4-dihydroxynonan-3-yl)-L-lysine 0
                  N(2)-methyl-L-lysine 0
                  N(6),N(6)-dimethyl-L-lysine + 0
                  N(6)-(1-carboxyethyl)-L-lysine 0
                  N(6)-(5'-adenylyl)-L-lysine 0
                  N(6)-(5'-guanylyl)-L-lysine 0
                  N(6)-(pyridoxal phosphate)-L-lysine + 0
                  N(6)-acetimidoyl-L-lysine 0
                  N(6)-acetyl-N(6)-methyl-L-lysine + 0
                  N(6)-acyl-L-lysine + 0
                  N(6)-carboxy-L-lysine + 0
                  N(6)-carboxymethyl-L-lysine + 0
                  N(6)-dansyl-L-lysine 0
                  N(6)-glycyl-L-lysine 0
                  N(6)-methyl-L-lysine + 0
                  N(alpha)-acetyl-L-lysine methyl ester 0
                  N(alpha)-citryl-N(epsilon)-acetyl-N(epsilon)-hydroxylysine 0
                  N(epsilon)-GMP-N(alpha)-acetyl-L-lysine methyl ester 0
                  N-(fatty acyl)-L-lysine zwitterion + 0
                  N6-3,4-didehydroretinylidene-L-lysine 0
                  N6-methyl-N6-poly(N-methyl-propylamine)-L-lysine 0
                  N6-mureinyl-L-lysine 0
                  N6-pyruvic acid 2-iminyl-L-lysine 0
                  N6-retinylidene-L-lysine 0
                  Peptidyl-L-lysine 0
                  acetyl-L-lysine + 0
                  aerobactin 0
                  amoxicilloyl-L-lysine + 0
                  an isonitrile lipopeptide + 0
                  aztreonyl-L-lysine + 0
                  benzylpenicilloyl-L-lysine + 0
                  biocytin + 0
                  deoxyhypusine + 0
                  erythro-5-phosphonooxy-L-lysine 0
                  flucloxacilloyl-L-lysine + 0
                  fructoselysine 6-phosphate 0
                  glyoxal-lysine dimer 0
                  heme P460-bis-L-cysteine-L-lysine 0
                  hydroxy-L-lysine + 0
                  hypusine + 0
                  indole-lysine conjugate + 0
                  lysidine + 0
                  lysidine monophosphate + 0
                  methylglyoxal-lysine dimer 0
                  piperacilloyl-L-lysine + 0
                  psicosyllysine 0
                  thiobenzyl benzyloxycarbonyl-L-lysinate 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19880
    subatomic particle 19878
      composite particle 19878
        hadron 19878
          baryon 19878
            nucleon 19878
              atomic nucleus 19878
                atom 19878
                  main group element atom 19817
                    main group molecular entity 19817
                      s-block molecular entity 19653
                        hydrogen molecular entity 19634
                          hydrides 19144
                            inorganic hydride 18161
                              pnictogen hydride 18151
                                nitrogen hydride 18064
                                  azane 17872
                                    ammonia 17871
                                      organic amino compound 17871
                                        amine 8299
                                          primary amine 6362
                                            primary aliphatic amine 191
                                              butan-1-amine 57
                                                4-aminobutyl group 56
                                                  lysine 56
                                                    L-lysine 56
                                                      L-lysine derivative 3
                                                        (3S)-3-hydroxy-L-lysine 0
                                                        (Z)-N(6)-[(4R,5S)-5-(2-carboxyethyl)-4-(carboxymethyl)piperidin-3-ylidene]-L-lysine 0
                                                        1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-1'-(3'-O-L-lysyl)-sn-glycerol 0
                                                        1-(L-norleucin-6-yl)pyrraline 0
                                                        4-chloro-L-lysine 0
                                                        5'-(N(6)-L-lysine)-L-tyrosylquinone + 0
                                                        5-[(alpha-D-glucopyranosyl-(1->2)-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-L-lysine + 0
                                                        5-glycosyloxy-L-lysine + 2
                                                        D-lysopine 0
                                                        L-2-aminohexano-6-lactam 0
                                                        L-796,778 0
                                                        L-homoarginine 1
                                                        L-homocitrulline + 0
                                                        L-lysinamide + 0
                                                        L-lysine 2-naphthylamide 0
                                                        L-lysine thiazolecarboxylic acid 0
                                                        L-lysyl ester + 0
                                                        L-lysyl levuloglandin E2 adduct 0
                                                        L-saccharopine 0
                                                        Lys-GalA 0
                                                        N(2)-(5'-phosphopyridoxyl)-L-lysine 0
                                                        N(2)-acetyl-N(6)-(1,4-dihydroxynonan-3-yl)-L-lysine 0
                                                        N(2)-methyl-L-lysine 0
                                                        N(6),N(6)-dimethyl-L-lysine + 0
                                                        N(6)-(1-carboxyethyl)-L-lysine 0
                                                        N(6)-(5'-adenylyl)-L-lysine 0
                                                        N(6)-(5'-guanylyl)-L-lysine 0
                                                        N(6)-(pyridoxal phosphate)-L-lysine + 0
                                                        N(6)-acetimidoyl-L-lysine 0
                                                        N(6)-acetyl-N(6)-methyl-L-lysine + 0
                                                        N(6)-acyl-L-lysine + 0
                                                        N(6)-carboxy-L-lysine + 0
                                                        N(6)-carboxymethyl-L-lysine + 0
                                                        N(6)-dansyl-L-lysine 0
                                                        N(6)-glycyl-L-lysine 0
                                                        N(6)-methyl-L-lysine + 0
                                                        N(alpha)-acetyl-L-lysine methyl ester 0
                                                        N(alpha)-citryl-N(epsilon)-acetyl-N(epsilon)-hydroxylysine 0
                                                        N(epsilon)-GMP-N(alpha)-acetyl-L-lysine methyl ester 0
                                                        N-(fatty acyl)-L-lysine zwitterion + 0
                                                        N6-3,4-didehydroretinylidene-L-lysine 0
                                                        N6-methyl-N6-poly(N-methyl-propylamine)-L-lysine 0
                                                        N6-mureinyl-L-lysine 0
                                                        N6-pyruvic acid 2-iminyl-L-lysine 0
                                                        N6-retinylidene-L-lysine 0
                                                        Peptidyl-L-lysine 0
                                                        acetyl-L-lysine + 0
                                                        aerobactin 0
                                                        amoxicilloyl-L-lysine + 0
                                                        an isonitrile lipopeptide + 0
                                                        aztreonyl-L-lysine + 0
                                                        benzylpenicilloyl-L-lysine + 0
                                                        biocytin + 0
                                                        deoxyhypusine + 0
                                                        erythro-5-phosphonooxy-L-lysine 0
                                                        flucloxacilloyl-L-lysine + 0
                                                        fructoselysine 6-phosphate 0
                                                        glyoxal-lysine dimer 0
                                                        heme P460-bis-L-cysteine-L-lysine 0
                                                        hydroxy-L-lysine + 0
                                                        hypusine + 0
                                                        indole-lysine conjugate + 0
                                                        lysidine + 0
                                                        lysidine monophosphate + 0
                                                        methylglyoxal-lysine dimer 0
                                                        piperacilloyl-L-lysine + 0
                                                        psicosyllysine 0
                                                        thiobenzyl benzyloxycarbonyl-L-lysinate 0
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